Suppr超能文献

使用 Cpf1-胞嘧啶脱氨酶融合进行碱基编辑。

Base editing with a Cpf1-cytidine deaminase fusion.

机构信息

School of Life Science and Technology, ShanghaiTech University, Shanghai, China.

Shanghai Institute of Biochemistry and Cell Biology, Chinese Academy of Sciences, Shanghai, China.

出版信息

Nat Biotechnol. 2018 Apr;36(4):324-327. doi: 10.1038/nbt.4102. Epub 2018 Mar 19.

Abstract

The targeting range of CRISPR-Cas9 base editors (BEs) is limited by their G/C-rich protospacer-adjacent motif (PAM) sequences. To overcome this limitation, we developed a CRISPR-Cpf1-based BE by fusing the rat cytosine deaminase APOBEC1 to a catalytically inactive version of Lachnospiraceae bacterium Cpf1. The base editor recognizes a T-rich PAM sequence and catalyzes C-to-T conversion in human cells, while inducing low levels of indels, non-C-to-T substitutions and off-target editing.

摘要

CRISPR-Cas9 碱基编辑器 (BE) 的靶向范围受到其富含 G/C 的原间隔基序 (PAM) 序列的限制。为了克服这一限制,我们通过将大鼠胞嘧啶脱氨酶 APOBEC1 融合到无活性的 Lachnospiraceae 细菌 Cpf1 上,开发了一种基于 CRISPR-Cpf1 的 BE。该碱基编辑器识别富含 T 的 PAM 序列,并在人细胞中催化 C 到 T 的转换,同时诱导低水平的插入缺失、非 C 到 T 的取代和脱靶编辑。

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