Suppr超能文献

一个经过整理的质粒序列综合数据库。

A Curated, Comprehensive Database of Plasmid Sequences.

作者信息

Brooks Lauren, Kaze Mo, Sistrom Mark

机构信息

Utah Valley University, Orem, Utah, USA.

University of California Merced, Merced, California, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2019 Jan 3;8(1). doi: 10.1128/MRA.01325-18. eCollection 2019 Jan.

Abstract

Plasmid sequences are central to a myriad of microbial functions and processes. Here, we have compiled a database of complete plasmid sequences and associated metadata curated from both NCBI's recent genome database update, which includes plasmids as organisms, and all available annotated bacterial genomes. The resultant database contains 10,892 complete plasmid sequences and associated metadata.

摘要

质粒序列对于众多微生物功能和过程至关重要。在此,我们编纂了一个完整质粒序列及相关元数据的数据库,这些数据来自美国国立生物技术信息中心(NCBI)近期的基因组数据库更新,其中包括作为生物体的质粒以及所有可用的已注释细菌基因组。最终的数据库包含10,892条完整质粒序列及相关元数据。

相似文献

1
A Curated, Comprehensive Database of Plasmid Sequences.一个经过整理的质粒序列综合数据库。
Microbiol Resour Announc. 2019 Jan 3;8(1). doi: 10.1128/MRA.01325-18. eCollection 2019 Jan.
5
6
NCBI Reference Sequences: current status, policy and new initiatives.NCBI参考序列:当前状态、政策及新举措。
Nucleic Acids Res. 2009 Jan;37(Database issue):D32-6. doi: 10.1093/nar/gkn721. Epub 2008 Oct 16.
9
VirGen: a comprehensive viral genome resource.VirGen:一个全面的病毒基因组资源库。
Nucleic Acids Res. 2004 Jan 1;32(Database issue):D289-92. doi: 10.1093/nar/gkh098.

引用本文的文献

2
Global Map of Specialized Metabolites Encoded in Prokaryotic Plasmids.全球原核质粒编码的特异性代谢物图谱
Microbiol Spectr. 2023 Aug 17;11(4):e0152323. doi: 10.1128/spectrum.01523-23. Epub 2023 Jun 13.
9
PLSDB: advancing a comprehensive database of bacterial plasmids.PLSDB:推进细菌质粒的综合数据库。
Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D273-D278. doi: 10.1093/nar/gkab1111.
10
CRISPR-Cas is associated with fewer antibiotic resistance genes in bacterial pathogens.CRISPR-Cas 与细菌病原体中的抗生素抗性基因较少有关。
Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2022 Jan 17;377(1842):20200464. doi: 10.1098/rstb.2020.0464. Epub 2021 Nov 29.

本文引用的文献

3
Plasmids foster diversification and adaptation of bacterial populations in soil.质粒促进土壤中细菌种群的多样化和适应。
FEMS Microbiol Rev. 2012 Nov;36(6):1083-104. doi: 10.1111/j.1574-6976.2012.00337.x. Epub 2012 Mar 26.
4
Network analyses structure genetic diversity in independent genetic worlds.网络分析构建独立遗传世界中的遗传多样性。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Jan 5;107(1):127-32. doi: 10.1073/pnas.0908978107. Epub 2009 Dec 10.
6
Bacteriocins: evolution, ecology, and application.细菌素:进化、生态学与应用
Annu Rev Microbiol. 2002;56:117-37. doi: 10.1146/annurev.micro.56.012302.161024. Epub 2002 Jan 30.

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验