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大肠杆菌虹吸噬菌体BRET的全基因组序列

Complete Genome Sequence of Escherichia coli Siphophage BRET.

作者信息

Ngazoa-Kakou Solange, Shao Yuyu, Rousseau Geneviève M, Addablah Audrey A, Tremblay Denise M, Hutinet Geoffrey, Lemire Nicolas, Plante Pier-Luc, Corbeil Jacques, Koudou Aristide, Soro Benjamin K, Coulibaly David N, Aoussi Serge, Dosso Mireille, Moineau Sylvain

机构信息

Plateforme de Biologie Moléculaire, Département Technique & Technologie, Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan, Côte d'Ivoire.

Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2019 Jan 31;8(5). doi: 10.1128/MRA.01644-18. eCollection 2019 Jan.

DOI:10.1128/MRA.01644-18
PMID:30714038
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6357644/
Abstract

The lytic Escherichia coli siphophage BRET was isolated from a chicken obtained at a local market in Abidjan, Côte d'Ivoire. Its linear genome sequence consists of 59,550 bp (43.4% GC content) and contains 88 predicted genes, including 4 involved in archaeosine biosynthesis. Phage BRET is related (95% nucleotide identity) to Enterobacteria phage JenK1.

摘要

裂解性大肠杆菌噬菌体BRET是从科特迪瓦阿比让当地市场购买的一只鸡中分离出来的。其线性基因组序列由59,550个碱基对组成(GC含量为43.4%),包含88个预测基因,其中4个参与古肌苷生物合成。噬菌体BRET与肠道杆菌噬菌体JenK1相关(核苷酸同一性为95%)。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a185/6357644/a5ee133392a0/MRA.01644-18-f0001.jpg
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