• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

NATF(天然组织荧光):一种在 中对天然蛋白进行明亮、组织特异性 GFP 标记的策略。

NATF (Native and Tissue-Specific Fluorescence): A Strategy for Bright, Tissue-Specific GFP Labeling of Native Proteins in .

机构信息

Program in Neuroscience, Vanderbilt University, Nashville, Tennessee.

Department of Cell and Developmental Biology, Vanderbilt University School of Medicine, Nashville, Tennessee 37240.

出版信息

Genetics. 2019 Jun;212(2):387-395. doi: 10.1534/genetics.119.302063. Epub 2019 Apr 5.

DOI:10.1534/genetics.119.302063
PMID:30952669
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6553825/
Abstract

GFP labeling by genome editing can reveal the authentic location of a native protein, but is frequently hampered by weak GFP signals and broad expression across a range of tissues that may obscure cell-specific localization. To overcome these problems, we engineered a Native And Tissue-specific Fluorescence (NATF) strategy that combines genome editing and split-GFP to yield bright, cell-specific protein labeling. We use clustered regularly interspaced short palindromic repeats CRISPR/Cas9 to insert a tandem array of seven copies of the GFP11 β-strand ( ) at the genomic locus of each target protein. The resultant knock-in strain is then crossed with separate reporter lines that express the complementing split-GFP fragment () in specific cell types, thus affording tissue-specific labeling of the target protein at its native level. We show that NATF reveals the otherwise undetectable intracellular location of the immunoglobulin protein OIG-1 and demarcates the receptor auxiliary protein LEV-10 at cell-specific synaptic domains in the nervous system.

摘要

通过基因组编辑进行 GFP 标记可以揭示天然蛋白质的真实位置,但 GFP 信号较弱且在广泛的组织中广泛表达,这可能会掩盖细胞特异性定位。为了克服这些问题,我们设计了一种 Native And Tissue-specific Fluorescence(NATF)策略,该策略结合了基因组编辑和分裂 GFP,以产生明亮的、细胞特异性的蛋白质标记。我们使用成簇的规律间隔的短回文重复 CRISPR/Cas9 将 GFP11 β-链的串联数组()插入每个靶蛋白的基因组位置。然后,将产生的 敲入菌株与分别表达在特定细胞类型中互补分裂 GFP 片段()的报告基因系杂交,从而以天然水平对靶蛋白进行组织特异性标记。我们表明,NATF 揭示了免疫球蛋白蛋白 OIG-1 的原本不可检测的细胞内位置,并在 神经系统中的特定突触域标记了受体辅助蛋白 LEV-10。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/666f68ca2033/387f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/2d7d7d26c83f/387f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/c30b769bbcb6/387f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/3b76460c74e7/387f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/666f68ca2033/387f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/2d7d7d26c83f/387f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/c30b769bbcb6/387f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/3b76460c74e7/387f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0034/6553825/666f68ca2033/387f4.jpg

相似文献

1
NATF (Native and Tissue-Specific Fluorescence): A Strategy for Bright, Tissue-Specific GFP Labeling of Native Proteins in .NATF(天然组织荧光):一种在 中对天然蛋白进行明亮、组织特异性 GFP 标记的策略。
Genetics. 2019 Jun;212(2):387-395. doi: 10.1534/genetics.119.302063. Epub 2019 Apr 5.
2
Split-wrmScarlet and split-sfGFP: tools for faster, easier fluorescent labeling of endogenous proteins in Caenorhabditis elegans.Split-wrmScarlet 和 split-sfGFP:在秀丽隐杆线虫中更快、更容易地对内源性蛋白进行荧光标记的工具。
Genetics. 2021 Apr 15;217(4). doi: 10.1093/genetics/iyab014.
3
Tissue-Specific Split sfGFP System for Streamlined Expression of GFP Tagged Proteins in the Germline.用于 GFP 标记蛋白在生殖系中精简表达的组织特异性分裂 sfGFP 系统。
G3 (Bethesda). 2019 Jun 5;9(6):1933-1943. doi: 10.1534/g3.119.400162.
4
[CRISPR-Cas9 mediated genome editing in Caenorhabditis elegans].[CRISPR-Cas9介导的秀丽隐杆线虫基因组编辑]
Sheng Wu Gong Cheng Xue Bao. 2017 Oct 25;33(10):1693-1699. doi: 10.13345/j.cjb.170177.
5
The application of somatic CRISPR-Cas9 to conditional genome editing in Caenorhabditis elegans.体细胞CRISPR-Cas9在秀丽隐杆线虫条件性基因组编辑中的应用。
Genesis. 2016 Apr;54(4):170-81. doi: 10.1002/dvg.22932. Epub 2016 Apr 14.
6
Oligonucleotide-based targeted gene editing in C. elegans via the CRISPR/Cas9 system.通过CRISPR/Cas9系统在秀丽隐杆线虫中基于寡核苷酸的靶向基因编辑。
Cell Res. 2014 Feb;24(2):247-50. doi: 10.1038/cr.2014.9. Epub 2014 Jan 14.
7
CRISPR-Cas9-Guided Genome Engineering in C. elegans.秀丽隐杆线虫中CRISPR-Cas9引导的基因组工程
Curr Protoc Mol Biol. 2016 Jul 1;115:31.7.1-31.7.18. doi: 10.1002/cpmb.7.
8
Comparative analysis of new mScarlet-based red fluorescent tags in Caenorhabditis elegans.新型基于 mScarlet 的红色荧光标签在秀丽隐杆线虫中的比较分析。
Genetics. 2024 Oct 7;228(2). doi: 10.1093/genetics/iyae126.
9
High-efficiency CRISPR gene editing in C. elegans using Cas9 integrated into the genome.利用整合到基因组中的 Cas9 在秀丽隐杆线虫中进行高效的 CRISPR 基因编辑。
PLoS Genet. 2021 Nov 8;17(11):e1009755. doi: 10.1371/journal.pgen.1009755. eCollection 2021 Nov.
10
Gene activation in Caenorhabditis elegans using the Campylobacter jejuni CRISPR-Cas9 feeding system.利用空肠弯曲杆菌 CRISPR-Cas9 喂食系统在秀丽隐杆线虫中进行基因激活。
G3 (Bethesda). 2022 May 30;12(6). doi: 10.1093/g3journal/jkac068.

引用本文的文献

1
A Toolkit for Mapping and Modulating Neurotransmission at Single-Cell Resolution.用于在单细胞分辨率下绘制和调节神经传递的工具包。
bioRxiv. 2025 Aug 18:2025.08.18.670838. doi: 10.1101/2025.08.18.670838.
2
A modular system to label endogenous presynaptic proteins using split fluorophores in Caenorhabditis elegans.一种利用分裂荧光团对线虫体内内源性突触前蛋白进行标记的模块化系统。
Genetics. 2025 Mar 17;229(3). doi: 10.1093/genetics/iyae214.
3
Detecting gene expression in Caenorhabditis elegans.检测秀丽隐杆线虫中的基因表达。

本文引用的文献

1
neurons have functional dendritic spines.神经元具有功能性树突棘。
Elife. 2019 Oct 4;8:e47918. doi: 10.7554/eLife.47918.
2
Neurexin directs partner-specific synaptic connectivity in .神经连接蛋白在. 中指导特定于伙伴的突触连接。
Elife. 2018 Jul 24;7:e35692. doi: 10.7554/eLife.35692.
3
Autoinhibition of kinesin-1 is essential to the dendrite-specific localization of Golgi outposts.动力蛋白-1 的自身抑制对于高尔基体前体在树突上的特异性定位是必不可少的。
Genetics. 2025 Jan 8;229(1):1-108. doi: 10.1093/genetics/iyae167.
4
CFI-1 functions unilaterally to restrict gap junction formation in C. elegans.CFI-1单方面发挥作用,限制秀丽隐杆线虫中缝隙连接的形成。
Development. 2025 Jan 1;152(1). doi: 10.1242/dev.202955. Epub 2025 Jan 7.
5
Neural Circuit Remodeling: Mechanistic Insights from Invertebrates.神经回路重塑:来自无脊椎动物的机制性见解
J Dev Biol. 2024 Oct 11;12(4):27. doi: 10.3390/jdb12040027.
6
UNC-30/PITX coordinates neurotransmitter identity with postsynaptic GABA receptor clustering.UNC-30/PITX 通过与突触后 GABA 受体簇集协调神经递质身份。
Development. 2024 Aug 15;151(16). doi: 10.1242/dev.202733. Epub 2024 Aug 27.
7
RABR-1, an atypical Rab-related GTPase, cell-nonautonomously restricts somatosensory dendrite branching.RABR-1,一种非典型的 Rab 相关 GTP 酶,非自主地限制躯体感觉树突分支。
Genetics. 2024 Oct 7;228(2). doi: 10.1093/genetics/iyae113.
8
Tissue-specific and endogenous protein labeling with split fluorescent proteins.利用分裂荧光蛋白进行组织特异性和内源性蛋白质标记。
Dev Biol. 2024 Oct;514:109-116. doi: 10.1016/j.ydbio.2024.06.011. Epub 2024 Jun 21.
9
Polarized localization of kinesin-1 and RIC-7 drives axonal mitochondria anterograde transport.驱动蛋白-1和RIC-7的极化定位驱动轴突线粒体的顺行运输。
J Cell Biol. 2024 May 6;223(5). doi: 10.1083/jcb.202305105. Epub 2024 Mar 12.
10
Tissue-specific and endogenous protein labeling with split fluorescent proteins.利用分裂荧光蛋白进行组织特异性和内源性蛋白质标记。
bioRxiv. 2024 Feb 28:2024.02.28.581822. doi: 10.1101/2024.02.28.581822.
J Cell Biol. 2018 Jul 2;217(7):2531-2547. doi: 10.1083/jcb.201708096. Epub 2018 May 4.
4
Improved split fluorescent proteins for endogenous protein labeling.用于内源性蛋白质标记的改进型分裂荧光蛋白。
Nat Commun. 2017 Aug 29;8(1):370. doi: 10.1038/s41467-017-00494-8.
5
Microtubule-dependent ribosome localization in neurons.神经元中微管依赖性核糖体的定位
Elife. 2017 Aug 2;6:e26376. doi: 10.7554/eLife.26376.
6
Reliable CRISPR/Cas9 Genome Engineering in Using a Single Efficient sgRNA and an Easily Recognizable Phenotype.利用高效 sgRNA 和易于识别的表型在 中进行可靠的 CRISPR/Cas9 基因组工程。
G3 (Bethesda). 2017 May 5;7(5):1429-1437. doi: 10.1534/g3.117.040824.
7
The Bright Fluorescent Protein mNeonGreen Facilitates Protein Expression Analysis .明亮荧光蛋白mNeonGreen有助于蛋白质表达分析。
G3 (Bethesda). 2017 Feb 9;7(2):607-615. doi: 10.1534/g3.116.038133.
8
Versatile protein tagging in cells with split fluorescent protein.利用分裂荧光蛋白在细胞中进行多功能蛋白质标记
Nat Commun. 2016 Mar 18;7:11046. doi: 10.1038/ncomms11046.
9
SapTrap, a Toolkit for High-Throughput CRISPR/Cas9 Gene Modification in Caenorhabditis elegans.SapTrap,一种用于秀丽隐杆线虫高通量CRISPR/Cas9基因编辑的工具包。
Genetics. 2016 Apr;202(4):1277-88. doi: 10.1534/genetics.115.184275. Epub 2016 Feb 2.
10
Transcriptional Control of Synaptic Remodeling through Regulated Expression of an Immunoglobulin Superfamily Protein.通过免疫球蛋白超家族蛋白的调控表达对突触重塑的转录控制
Curr Biol. 2015 Oct 5;25(19):2541-8. doi: 10.1016/j.cub.2015.08.022. Epub 2015 Sep 17.