• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种通过滚环扩增特异性检测环状 RNA 的快速简便方法。

A Fast and Easy Method for Specific Detection of Circular RNA by Rolling-Circle Amplification.

机构信息

Institute for Chemistry, Humboldt Universität zu Berlin, Brook-Taylor-Str. 2, 12489, Berlin, Germany.

出版信息

Chembiochem. 2020 Mar 16;21(6):793-796. doi: 10.1002/cbic.201900514. Epub 2019 Nov 27.

DOI:10.1002/cbic.201900514
PMID:31584239
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7154740/
Abstract

Circular RNAs (circRNAs) represent a new class of usually noncoding transcripts with largely unknown functions. Their research is hampered not least by the inapplicability of traditional analytical methods. Herein we describe a rapid and easy assay for the detection of natural circRNA, based on rolling-circle amplification (RCA). This technique does not require the use of fluorescently labeled RNA or DNA and can specifically detect circular RNA in the presence of a 1000-fold excess of the same linear RNA. Only standard devices such as (quantitative) PCR cyclers and gel electrophoresis are used.

摘要

环状 RNA(circRNAs)代表了一类通常是非编码转录本的新型分子,其功能在很大程度上尚不清楚。它们的研究受到传统分析方法不适用的阻碍。本文描述了一种基于滚环扩增(RCA)的快速简便的天然环状 RNA 检测方法。该技术不需要使用荧光标记的 RNA 或 DNA,并且可以在存在 1000 倍过量相同线性 RNA 的情况下特异性检测环状 RNA。仅使用标准设备,如(定量)PCR 循环仪和凝胶电泳。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/b59bca5a2ab4/CBIC-21-793-g005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/21b6cc4ce4d1/CBIC-21-793-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/ffd64c5afe41/CBIC-21-793-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/404527e2bab6/CBIC-21-793-g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/b18c2c81262f/CBIC-21-793-g004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/b59bca5a2ab4/CBIC-21-793-g005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/21b6cc4ce4d1/CBIC-21-793-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/ffd64c5afe41/CBIC-21-793-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/404527e2bab6/CBIC-21-793-g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/b18c2c81262f/CBIC-21-793-g004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4dca/7154740/b59bca5a2ab4/CBIC-21-793-g005.jpg

相似文献

1
A Fast and Easy Method for Specific Detection of Circular RNA by Rolling-Circle Amplification.一种通过滚环扩增特异性检测环状 RNA 的快速简便方法。
Chembiochem. 2020 Mar 16;21(6):793-796. doi: 10.1002/cbic.201900514. Epub 2019 Nov 27.
2
Direct detection of circRNA in real samples using reverse transcription-rolling circle amplification.使用反转录-滚环扩增技术直接检测真实样本中的 circRNA。
Anal Chim Acta. 2020 Mar 8;1101:169-175. doi: 10.1016/j.aca.2019.12.027. Epub 2019 Dec 26.
3
In situ hybridization assay for circular RNA visualization based on padlock probe and rolling circle amplification.基于锁式探针和滚环扩增的环状RNA可视化原位杂交检测法。
Biochem Biophys Res Commun. 2022 Jun 25;610:30-34. doi: 10.1016/j.bbrc.2022.04.034. Epub 2022 Apr 10.
4
The Discovery of Rolling Circle Amplification and Rolling Circle Transcription.环化扩增和环化转录的发现。
Acc Chem Res. 2016 Nov 15;49(11):2540-2550. doi: 10.1021/acs.accounts.6b00417. Epub 2016 Oct 24.
5
Specific and sensitive detection of CircRNA based on netlike hybridization chain reaction.基于网状杂交链式反应的环状 RNA 的特异性和灵敏检测。
Biosens Bioelectron. 2021 Nov 15;192:113508. doi: 10.1016/j.bios.2021.113508. Epub 2021 Jul 16.
6
Rolling Circle cDNA Synthesis Uncovers Circular RNA Splice Variants.滚环 cDNA 合成揭示环状 RNA 剪接变体。
Int J Mol Sci. 2019 Aug 16;20(16):3988. doi: 10.3390/ijms20163988.
7
Validation of Circular RNAs by PCR.通过聚合酶链式反应验证环状核糖核酸
Methods Mol Biol. 2022;2392:103-114. doi: 10.1007/978-1-0716-1799-1_8.
8
Direct recognition and sensitive detection of circular RNA with ligation-based PCR.基于连接酶 PCR 的环状 RNA 的直接识别和灵敏检测。
Org Biomol Chem. 2020 May 6;18(17):3269-3273. doi: 10.1039/d0ob00625d.
9
Multiple stem-loop primers induced cascaded loop-mediated isothermal amplification for direct recognition and specific detection of circular RNAs.多茎环引物诱导级联环介导等温扩增,用于环状 RNA 的直接识别和特异性检测。
Analyst. 2022 May 17;147(10):2124-2129. doi: 10.1039/d2an00261b.
10
Ultrasensitive detection of circular RNA by accurate recognition of the specific junction site using stem-loop primer induced double exponential amplification.利用茎环引物诱导的双指数扩增对特定连接位点的精确识别实现环状 RNA 的超灵敏检测。
Talanta. 2020 Sep 1;217:121021. doi: 10.1016/j.talanta.2020.121021. Epub 2020 Apr 12.

引用本文的文献

1
CircPrime: a web-based platform for design of specific circular RNA primers.CircPrime:一个基于网络的特定环状 RNA 引物设计平台。
BMC Bioinformatics. 2023 May 19;24(1):205. doi: 10.1186/s12859-023-05331-y.
2
Enzyme-Assisted Nucleic Acid Amplification in Molecular Diagnosis: A Review.酶辅助核酸扩增在分子诊断中的应用:综述。
Biosensors (Basel). 2023 Jan 19;13(2):160. doi: 10.3390/bios13020160.
3
Roles of circRNAs in hematological malignancies.环状RNA在血液系统恶性肿瘤中的作用。

本文引用的文献

1
A method to directly assay circRNA in real samples.一种直接检测真实样本中环状 RNA 的方法。
Chem Commun (Camb). 2018 Nov 27;54(95):13451-13454. doi: 10.1039/c8cc08319c.
2
Profiling and bioinformatics analyses reveal differential circular RNA expression in hypertensive patients.分析和生物信息学分析揭示了高血压患者中差异表达的环状 RNA。
Clin Exp Hypertens. 2017;39(5):454-459. doi: 10.1080/10641963.2016.1273944. Epub 2017 May 23.
3
Circ-ZNF609 Is a Circular RNA that Can Be Translated and Functions in Myogenesis.环状锌指蛋白609是一种可翻译并在肌肉生成中发挥作用的环状RNA。
Biomark Res. 2022 Jul 15;10(1):50. doi: 10.1186/s40364-022-00392-2.
4
BmCPV-Derived Circular DNA vcDNA-S7 Mediated by Reverse Transcriptase (RT) Regulates BmCPV Infection.BmCPV 衍生的环状 DNA vcDNA-S7 通过逆转录酶 (RT) 介导调控 BmCPV 感染。
Front Immunol. 2022 Mar 15;13:861007. doi: 10.3389/fimmu.2022.861007. eCollection 2022.
5
Rolling Circle Amplification as a Universal Method for the Analysis of a Wide Range of Biological Targets.滚环扩增作为一种用于分析多种生物靶标的通用方法。
Russ J Bioorg Chem. 2021;47(6):1172-1189. doi: 10.1134/S1068162021060078. Epub 2021 Dec 16.
6
Formation of Visible Aggregates between Rolling Circle Amplification Products and Magnetic Nanoparticles as a Strategy for Point-of-Care Diagnostics.滚环扩增产物与磁性纳米颗粒之间形成可见聚集体作为即时诊断策略
ACS Omega. 2021 Nov 23;6(48):32970-32976. doi: 10.1021/acsomega.1c05047. eCollection 2021 Dec 7.
7
The Role and Clinical Potentials of Circular RNAs in Prostate Cancer.环状RNA在前列腺癌中的作用及临床潜力
Front Oncol. 2021 Nov 5;11:781414. doi: 10.3389/fonc.2021.781414. eCollection 2021.
8
circFL-seq reveals full-length circular RNAs with rolling circular reverse transcription and nanopore sequencing.circFL-seq 揭示了具有滚环反转录的全长环状 RNA 与纳米孔测序。
Elife. 2021 Oct 14;10:e69457. doi: 10.7554/eLife.69457.
9
CircRNAs and their regulatory roles in cancers.环状RNA及其在癌症中的调控作用。
Mol Med. 2021 Aug 26;27(1):94. doi: 10.1186/s10020-021-00359-3.
10
Nanoribbon-Based Electronic Detection of a Glioma-Associated Circular miRNA.基于纳米带的脑胶质瘤相关环状 miRNA 的电子检测
Biosensors (Basel). 2021 Jul 13;11(7):237. doi: 10.3390/bios11070237.
Mol Cell. 2017 Apr 6;66(1):22-37.e9. doi: 10.1016/j.molcel.2017.02.017. Epub 2017 Mar 23.
4
Circular RNA profile identifies circPVT1 as a proliferative factor and prognostic marker in gastric cancer.环状RNA谱鉴定出circPVT1作为胃癌中的增殖因子和预后标志物。
Cancer Lett. 2017 Mar 1;388:208-219. doi: 10.1016/j.canlet.2016.12.006. Epub 2016 Dec 13.
5
In vitro circularization of RNA.体外 RNA 环化。
RNA Biol. 2017 Aug 3;14(8):1018-1027. doi: 10.1080/15476286.2016.1239009. Epub 2016 Sep 26.
6
A Rapid and Versatile Assay for Ago2-Mediated Cleavage by Using Branched Rolling Circle Amplification.一种利用分支滚环扩增快速且通用的Ago2介导切割检测方法。
Chembiochem. 2016 Feb 15;17(4):304-7. doi: 10.1002/cbic.201500537. Epub 2016 Jan 8.
7
Exon circularization requires canonical splice signals.外显子环化需要典型的剪接信号。
Cell Rep. 2015 Jan 6;10(1):103-11. doi: 10.1016/j.celrep.2014.12.002. Epub 2014 Dec 24.
8
CRKL protein overexpression enhances cell proliferation and invasion in pancreatic cancer.CRKL蛋白过表达增强胰腺癌的细胞增殖和侵袭能力。
Tumour Biol. 2015 Feb;36(2):1015-22. doi: 10.1007/s13277-014-2706-2. Epub 2014 Oct 16.
9
circRNA biogenesis competes with pre-mRNA splicing.circRNA 的生物发生与前体 mRNA 剪接竞争。
Mol Cell. 2014 Oct 2;56(1):55-66. doi: 10.1016/j.molcel.2014.08.019. Epub 2014 Sep 18.
10
Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency.环状 RNA 是一大类具有调控能力的动物 RNA。
Nature. 2013 Mar 21;495(7441):333-8. doi: 10.1038/nature11928. Epub 2013 Feb 27.