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2020 年 1 月和 2 月在意大利分离的两株 SARS-CoV-2 病毒的全基因组和系统进化分析:关于多次传入和在欧洲进一步传播的更多线索。

Whole genome and phylogenetic analysis of two SARS-CoV-2 strains isolated in Italy in January and February 2020: additional clues on multiple introductions and further circulation in Europe.

机构信息

Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanità, Rome, Italy.

Scientific Department Army Medical Center, Rome, Italy.

出版信息

Euro Surveill. 2020 Apr;25(13). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.13.2000305.

Abstract

Whole genome sequences of SARS-CoV-2 obtained from two patients, a Chinese tourist visiting Rome and an Italian, were compared with sequences from Europe and elsewhere. In a phylogenetic tree, the Italian patient's sequence clustered with sequences from Germany while the tourist's sequence clustered with other European sequences. Some additional European sequences in the tree segregated outside the two clusters containing the patients' sequences. This suggests multiple SARS-CoV-2 introductions in Europe or virus evolution during circulation.

摘要

对两名患者(一名是访意的中国游客,另一名是意大利人)的 SARS-CoV-2 全基因组序列与来自欧洲和其他地区的序列进行了比较。在系统进化树上,意大利患者的序列与德国序列聚为一簇,而中国游客的序列则与其他欧洲序列聚为一簇。树中还有一些其他的欧洲序列分离在包含这两例患者序列的两个簇之外。这提示在欧洲有多次 SARS-CoV-2 的输入,或者病毒在传播过程中发生了进化。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4f2c/7140597/ea92b5c2cc6d/2000305-f1.jpg

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