Suppr超能文献

新型试剂空间:识别无法订购但易于合成的构建模块。

Novel Reagent Space: Identifying Unorderable but Readily Synthesizable Building Blocks.

作者信息

Seierstad Mark, Tichenor Mark S, DesJarlais Renee L, Na Jim, Bacani Genesis M, Chung De Michael, Mercado-Marin Eduardo V, Steffens Helena C, Mirzadegan Taraneh

机构信息

Janssen Research and Development, San Diego, California 92121, United States.

Janssen Research and Development, Spring House, Pennsylvania 19477, United States.

出版信息

ACS Med Chem Lett. 2021 Oct 25;12(11):1853-1860. doi: 10.1021/acsmedchemlett.1c00340. eCollection 2021 Nov 11.

Abstract

Drug discovery building blocks available commercially or within an internal inventory cover a diverse range of chemical space and yet describe only a tiny fraction of all chemically feasible reagents. Vendors will eagerly provide tools to search the former; there is no straightforward method of mining the latter. We describe a procedure and use case in assembling chemical structures not available for purchase but that could likely be synthesized in one robust chemical transformation starting from readily available building blocks. Accessing this vast virtual chemical space dramatically increases our curated collection of reagents available for medicinal chemistry exploration and novel hit generation, almost tripling the number of those with 10 or fewer atoms.

摘要

可通过商业途径获取或来自内部库存的药物发现基础模块涵盖了各种各样的化学空间,但仅描述了所有化学上可行试剂中的极小一部分。供应商会热切地提供工具来搜索前者;而挖掘后者却没有直接的方法。我们描述了一种程序和用例,用于组装无法购买但从现成的基础模块开始,通过一个稳健的化学转化很可能可以合成的化学结构。进入这个广阔的虚拟化学空间极大地增加了我们为药物化学探索和新活性分子生成而精心策划的试剂库,使含10个或更少原子的试剂数量几乎增加了两倍。

相似文献

1
Novel Reagent Space: Identifying Unorderable but Readily Synthesizable Building Blocks.新型试剂空间:识别无法订购但易于合成的构建模块。
ACS Med Chem Lett. 2021 Oct 25;12(11):1853-1860. doi: 10.1021/acsmedchemlett.1c00340. eCollection 2021 Nov 11.
5
Idea2Data: Toward a New Paradigm for Drug Discovery.从想法到数据:迈向药物发现的新范式
ACS Med Chem Lett. 2019 Feb 4;10(3):278-286. doi: 10.1021/acsmedchemlett.8b00488. eCollection 2019 Mar 14.
6
ChemDB update--full-text search and virtual chemical space.化学数据库更新——全文搜索与虚拟化学空间
Bioinformatics. 2007 Sep 1;23(17):2348-51. doi: 10.1093/bioinformatics/btm341. Epub 2007 Jun 28.

引用本文的文献

1
ASKCOS: Open-Source, Data-Driven Synthesis Planning.ASKCOS:开源、数据驱动的合成规划。
Acc Chem Res. 2025 Jun 3;58(11):1764-1775. doi: 10.1021/acs.accounts.5c00155. Epub 2025 May 21.
3
Enabling Deoxygenative C(sp)-C(sp) Cross-Coupling for Parallel Medicinal Chemistry.实现用于平行药物化学的脱氧C(sp)-C(sp)交叉偶联反应。
ACS Med Chem Lett. 2023 May 22;14(6):853-859. doi: 10.1021/acsmedchemlett.3c00118. eCollection 2023 Jun 8.

本文引用的文献

3
Artificial intelligence in chemistry and drug design.化学与药物设计中的人工智能
J Comput Aided Mol Des. 2020 Jul;34(7):709-715. doi: 10.1007/s10822-020-00317-x.
4
The Synthesizability of Molecules Proposed by Generative Models.生成式模型提出的分子可合成性。
J Chem Inf Model. 2020 Dec 28;60(12):5714-5723. doi: 10.1021/acs.jcim.0c00174. Epub 2020 Apr 17.
6
Creating a Virtual Assistant for Medicinal Chemistry.创建一个用于药物化学的虚拟助手。
ACS Med Chem Lett. 2019 Jun 7;10(7):1051-1055. doi: 10.1021/acsmedchemlett.9b00151. eCollection 2019 Jul 11.
8
PubChem 2019 update: improved access to chemical data.PubChem 2019 年更新:改善化学数据获取。
Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D1102-D1109. doi: 10.1093/nar/gky1033.
9
Virtual Chemical Libraries.虚拟化学文库。
J Med Chem. 2019 Feb 14;62(3):1116-1124. doi: 10.1021/acs.jmedchem.8b01048. Epub 2018 Sep 10.
10
What Makes a Great Medicinal Chemist? A Personal Perspective.是什么造就了杰出的药物化学家?个人观点。
J Med Chem. 2018 Sep 13;61(17):7419-7424. doi: 10.1021/acs.jmedchem.7b01445. Epub 2018 May 22.

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验