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ATAC-See:一种用于通过成像检测染色质可及性的Tn5转座酶介导的分析方法。

ATAC-See: A Tn5 Transposase-Mediated Assay for Detection of Chromatin Accessibility with Imaging.

作者信息

Dang Yonglong, Yadav Ram Prakash, Chen Xingqi

机构信息

Department of Immunology, Genetics and Pathology, Uppsala University, Uppsala, Sweden.

出版信息

Methods Mol Biol. 2023;2611:285-291. doi: 10.1007/978-1-0716-2899-7_15.

DOI:10.1007/978-1-0716-2899-7_15
PMID:36807074
Abstract

Assay of transposase-accessible chromatin with visualization (ATAC-see), a transposase-mediated imaging technology that enables direct imaging of the accessible genome in situ and deep sequencing to reveal the identity of the imaged elements. Here we image spatial organization of the accessible genome in HT1080 cells with this method.

摘要

带可视化的转座酶可及染色质分析(ATAC-see),一种转座酶介导的成像技术,能够对可及基因组进行原位直接成像,并通过深度测序揭示成像元件的身份。在此,我们用这种方法对HT1080细胞中可及基因组的空间组织进行成像。

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