在欧洲小叶椴中鉴定出一种导致叶片广泛黄化的新型细胞质弹状病毒的编码完整基因组序列。
Identification of the Coding-Complete Genome Sequence of a Novel Cytorhabdovirus in Tilia cordata Showing Extensive Leaf Chloroses.
作者信息
Köpke Kira, Rumbou Artemis, von Bargen Susanne, Büttner Carmen
机构信息
Division Phytomedicine, Thaer-Institute of Agricultural and Horticultural Sciences, Humboldt-Universität zu Berlin, Berlin, Germany.
出版信息
Microbiol Resour Announc. 2023 Apr 18;12(4):e0005223. doi: 10.1128/mra.00052-23. Epub 2023 Mar 16.
Here, we report the coding-complete sequence (14,152 nucleotides [nt]) of a novel cytorhabdovirus detected in Tilia cordata and tentatively named cytorhabdovirus tiliae. The assumed genome organization is 3'-N-P-P3-M-G-p6-p6'-L-5'. The N gene encodes the putative nucleoprotein (59.1 kDa), P encodes the phosphoprotein (34.7 kDa), P3 encodes the movement protein (23.1 kDa), M encodes the matrix protein (23.1 kDa), G encodes a glycoprotein (64.4 kDa), and L encodes the viral RNA polymerase (247 kDa). P6 and P6' are overlapping open reading frames (ORFs), which may encode gene products of 7.9 and 9.5 kDa, respectively, of unknown functions.
在此，我们报告了在欧洲小叶椴中检测到的一种新型细胞质弹状病毒的编码完整序列（14,152个核苷酸[nt]），并暂定名为椴树细胞质弹状病毒。假定的基因组结构为3'-N-P-P3-M-G-p6-p6'-L-5'。N基因编码假定的核蛋白（59.1 kDa），P基因编码磷蛋白（34.7 kDa），P3基因编码运动蛋白（23.1 kDa），M基因编码基质蛋白（23.1 kDa），G基因编码糖蛋白（64.4 kDa），L基因编码病毒RNA聚合酶（247 kDa）。P6和P6'是重叠开放阅读框（ORF），可能分别编码功能未知的7.9 kDa和9.5 kDa的基因产物。
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