• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

使用荧光报告分子测定细胞裂解物中的精氨酰化活性。

Assaying Arginylation Activity in Cell Lysates Using a Fluorescent Reporter.

作者信息

Kumar Akhilesh, Zhang Fangliang

机构信息

Department of Botany, Banaras Hindu University, Varanasi, UP, India.

Department of Molecular & Cellular Pharmacology, University of Miami Leonard M. Miller School of Medicine, Miami, FL, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2023;2620:71-80. doi: 10.1007/978-1-0716-2942-0_9.

DOI:10.1007/978-1-0716-2942-0_9
PMID:37010750
Abstract

Here, we describe an antibody-based method to evaluate the enzymatic activity of arginyltransferase1 (Ate1). The assay is based on the arginylation of a reporter protein, which contains the N-terminal peptide of beta-actin, a known endogenous substrate of Ate1, and a C-terminal GFP. The arginylation level of the reporter protein is determined  on an immunoblot with an antibody specific for the arginylated N-terminus, while the total amount of substrate is evaluated with anti-GFP antibody. This method can be used to conveniently and accurately examine the Ate1 activity in yeast and mammalian cell lysates. Moreover, the effect of mutation on Ate1 critical residues and effect of stress and other factors on Ate1 activity can also be successfully determined with this method.

摘要

在此,我们描述了一种基于抗体的方法来评估精氨酰转移酶1(Ate1)的酶活性。该测定基于一种报告蛋白的精氨酰化,该报告蛋白包含β-肌动蛋白的N端肽(Ate1的一种已知内源性底物)和C端绿色荧光蛋白(GFP)。使用针对精氨酰化N端的特异性抗体通过免疫印迹法测定报告蛋白的精氨酰化水平,同时用抗GFP抗体评估底物的总量。该方法可用于方便且准确地检测酵母和哺乳动物细胞裂解物中的Ate1活性。此外,用该方法还能成功确定Ate1关键残基突变的影响以及应激和其他因素对Ate1活性的影响。

相似文献

1
Assaying Arginylation Activity in Cell Lysates Using a Fluorescent Reporter.使用荧光报告分子测定细胞裂解物中的精氨酰化活性。
Methods Mol Biol. 2023;2620:71-80. doi: 10.1007/978-1-0716-2942-0_9.
2
Assaying Intracellular Arginylation Activity Using a Fluorescent Reporter.使用荧光报告基因检测细胞内精氨酰化活性。
Methods Mol Biol. 2023;2620:81-85. doi: 10.1007/978-1-0716-2942-0_10.
3
Posttranslational arginylation enzyme Ate1 affects DNA mutagenesis by regulating stress response.翻译后修饰精氨酰化酶Ate1通过调节应激反应影响DNA诱变。
Cell Death Dis. 2016 Sep 29;7(9):e2378. doi: 10.1038/cddis.2016.284.
4
Assaying for Arginyltransferase Activity and Specificity by Peptide Arrays.通过肽阵列分析精氨酰转移酶活性和特异性
Methods Mol Biol. 2023;2620:123-127. doi: 10.1007/978-1-0716-2942-0_17.
5
Ate1-mediated posttranslational arginylation affects substrate adhesion and cell migration in Dictyostelium discoideum.Ate1 介导的翻译后精氨酸化影响盘基网柄菌中底物黏附和细胞迁移。
Mol Biol Cell. 2019 Feb 15;30(4):453-466. doi: 10.1091/mbc.E18-02-0132. Epub 2018 Dec 26.
6
Analyzing N-terminal Arginylation through the Use of Peptide Arrays and Degradation Assays.通过使用肽阵列和降解试验分析N端精氨酰化
J Biol Chem. 2016 Sep 30;291(40):20976-20992. doi: 10.1074/jbc.M116.747956. Epub 2016 Aug 10.
7
Assaying ATE1 Activity in Yeast by β-Gal Degradation.通过β-半乳糖苷酶降解测定酵母中的ATE1活性。
Methods Mol Biol. 2023;2620:63-70. doi: 10.1007/978-1-0716-2942-0_8.
8
Global Analysis of Post-Translational Side-Chain Arginylation Using Pan-Arginylation Antibodies.泛精氨酸化抗体对翻译后侧链精氨酸化的全局分析。
Mol Cell Proteomics. 2023 Nov;22(11):100664. doi: 10.1016/j.mcpro.2023.100664. Epub 2023 Oct 12.
9
High-Throughput Arginylation Assay in Microplate Format.微孔板形式的高通量精氨酰化分析
Methods Mol Biol. 2023;2620:119-122. doi: 10.1007/978-1-0716-2942-0_16.
10
Crystal structure of the Ate1 arginyl-tRNA-protein transferase and arginylation of N-degron substrates.Ate1 精氨酰-tRNA 蛋白转移酶的晶体结构和 N 降解物底物的精氨酰化
Proc Natl Acad Sci U S A. 2022 Aug 2;119(31):e2209597119. doi: 10.1073/pnas.2209597119. Epub 2022 Jul 25.

本文引用的文献

1
The evolutionarily conserved arginyltransferase 1 mediates a pVHL-independent oxygen-sensing pathway in mammalian cells.进化上保守的精氨酰转移酶 1 介导了哺乳动物细胞中一种与 pVHL 无关的氧感应途径。
Dev Cell. 2022 Mar 14;57(5):654-669.e9. doi: 10.1016/j.devcel.2022.02.010. Epub 2022 Mar 4.
2
ATE1-Mediated Post-Translational Arginylation Is an Essential Regulator of Eukaryotic Cellular Homeostasis.ATE1 介导的翻译后精氨酸化是真核细胞内稳态的必需调节因子。
ACS Chem Biol. 2020 Dec 18;15(12):3073-3085. doi: 10.1021/acschembio.0c00677. Epub 2020 Nov 23.
3
Target site specificity and in vivo complexity of the mammalian arginylome.
哺乳动物精氨酸组的靶位特异性和体内复杂性。
Sci Rep. 2018 Nov 1;8(1):16177. doi: 10.1038/s41598-018-34639-6.
4
Protein arginylation regulates cellular stress response by stabilizing HSP70 and HSP40 transcripts.蛋白质精氨酰化通过稳定HSP70和HSP40转录本调节细胞应激反应。
Cell Death Discov. 2016 Oct 3;2:16074. doi: 10.1038/cddiscovery.2016.74. eCollection 2016.
5
Posttranslational arginylation enzyme Ate1 affects DNA mutagenesis by regulating stress response.翻译后修饰精氨酰化酶Ate1通过调节应激反应影响DNA诱变。
Cell Death Dis. 2016 Sep 29;7(9):e2378. doi: 10.1038/cddis.2016.284.
6
Assaying ATE1 Activity in Yeast by β-Gal Degradation.通过β-半乳糖苷酶降解测定酵母中的ATE1活性。
Methods Mol Biol. 2015;1337:59-65. doi: 10.1007/978-1-4939-2935-1_8.
7
Small molecule inhibitors of arginyltransferase regulate arginylation-dependent protein degradation, cell motility, and angiogenesis.精氨酸转移酶小分子抑制剂调节依赖精氨酸化的蛋白质降解、细胞迁移和血管生成。
Biochem Pharmacol. 2012 Apr 1;83(7):866-73. doi: 10.1016/j.bcp.2012.01.012. Epub 2012 Jan 18.
8
Posttranslational arginylation as a global biological regulator.翻译后修饰的精氨酰化作为一种全局生物调节因子。
Dev Biol. 2011 Oct 1;358(1):1-8. doi: 10.1016/j.ydbio.2011.06.043. Epub 2011 Jul 18.
9
Differential arginylation of actin isoforms is regulated by coding sequence-dependent degradation.肌动蛋白异构体的差异精氨酸化受编码序列依赖性降解调节。
Science. 2010 Sep 17;329(5998):1534-7. doi: 10.1126/science.1191701.
10
Arginyltransferase, its specificity, putative substrates, bidirectional promoter, and splicing-derived isoforms.精氨酰转移酶、其特异性、假定底物、双向启动子以及剪接衍生的同工型。
J Biol Chem. 2006 Oct 27;281(43):32559-73. doi: 10.1074/jbc.M604355200. Epub 2006 Aug 30.