Suppr超能文献

当前 FCS 的能力和未来展望:超分辨率显微镜、机器学习和活体应用。

Current capabilities and future perspectives of FCS: super-resolution microscopy, machine learning, and in vivo applications.

机构信息

Genome Institute of Singapore, Agency for Science, Technology and Research, Singapore, 138632, Singapore.

Department of Biological Sciences, National University of Singapore, Singapore, 117558, Singapore.

出版信息

Commun Biol. 2023 Jul 7;6(1):699. doi: 10.1038/s42003-023-05069-6.

Abstract

Fluorescence correlation spectroscopy (FCS) is a single molecule sensitive tool for the quantitative measurement of biomolecular dynamics and interactions. Improvements in biology, computation, and detection technology enable real-time FCS experiments with multiplexed detection even in vivo. These new imaging modalities of FCS generate data at the rate of hundreds of MB/s requiring efficient data processing tools to extract information. Here, we briefly review FCS's capabilities and limitations before discussing recent directions that address these limitations with a focus on imaging modalities of FCS, their combinations with super-resolution microscopy, new evaluation strategies, especially machine learning, and applications in vivo.

摘要

荧光相关光谱学(FCS)是一种用于定量测量生物分子动力学和相互作用的单分子敏感工具。生物学、计算和检测技术的改进使得即使在体内也可以进行实时的多重检测的 FCS 实验。这些新的 FCS 成像模式以数百 MB/s 的速率生成数据,需要有效的数据处理工具来提取信息。在讨论最近的一些方向之前,我们先简要回顾一下 FCS 的能力和局限性,这些方向重点解决了 FCS 的成像模式、与超分辨率显微镜的结合、新的评估策略(特别是机器学习)以及体内应用中的这些局限性。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e5ee/10328937/d7d40e65db46/42003_2023_5069_Fig1_HTML.jpg

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