• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

来自甜菜工厂果汁和生物膜的、和分离株的全基因组测序。

Whole genome sequencing of , , and isolates from sugar beet factory juice and biofilms.

作者信息

Joshi Sanjay, Bruni Gillian O

机构信息

U.S. Department of Agriculture, Agricultural Research Service, Southern Regional Research Center, New Orleans, Louisiana, USA.

U.S. Department of Energy, Oak Ridge Institute for Science and Education, Oak Ridge, Tennessee, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2025 Aug 14;14(8):e0035325. doi: 10.1128/mra.00353-25. Epub 2025 Jul 7.

DOI:10.1128/mra.00353-25
PMID:40621940
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12352076/
Abstract

species are one of the predominant taxa found in post-harvest sugar beet factory processing streams. This study provides the genomes of 10 isolates identified as either , , or , obtained from sugar beet juice and biofilm samples collected from factories across North America.

摘要

物种是收获后甜菜制糖厂加工流中发现的主要分类群之一。本研究提供了从北美各地工厂采集的甜菜汁和生物膜样本中鉴定出的10株分离株的基因组，这些分离株被鉴定为 、 或 。

相似文献

1
Whole genome sequencing of , , and isolates from sugar beet factory juice and biofilms.来自甜菜工厂果汁和生物膜的、和分离株的全基因组测序。
Microbiol Resour Announc. 2025 Aug 14;14(8):e0035325. doi: 10.1128/mra.00353-25. Epub 2025 Jul 7.
2
Fungal and Bacterial Species Associated with Storage Diseases in Sugar Beet from the Red River Valley of Minnesota and North Dakota.与明尼苏达州和北达科他州红河河谷甜菜贮藏病害相关的真菌和细菌物种
Plant Dis. 2025 Aug;109(8):1702-1712. doi: 10.1094/PDIS-10-24-2188-RE. Epub 2025 Aug 13.
3
Whole genome sequencing of and isolates extracted from sugar beet roots.从甜菜根中提取的[具体名称1]和[具体名称2]分离株的全基因组测序。
Microbiol Resour Announc. 2024 Oct 10;13(10):e0072724. doi: 10.1128/mra.00727-24. Epub 2024 Sep 11.
4
Biofilm formation by strains of Leuconostoc citreum and L. mesenteroides.柠檬明串珠菌和肠膜明串珠菌菌株的生物膜形成。
Biotechnol Lett. 2011 Mar;33(3):517-23. doi: 10.1007/s10529-010-0450-2. Epub 2010 Nov 3.
5
A proposal of Leuconostoc mesenteroides subsp. jonggajibkimchii subsp. nov. and reclassification of Leuconostoc mesenteroides subsp. suionicum (Gu et al., 2012) as Leuconostoc suionicum sp. nov. based on complete genome sequences.基于全基因组序列提出嗜柠檬酸明串珠菌jonggajibkimchii亚种新亚种，并将嗜柠檬酸明串珠菌猪源亚种（Gu等人，2012年）重新分类为猪源明串珠菌新种。
Int J Syst Evol Microbiol. 2017 Jul;67(7):2225-2230. doi: 10.1099/ijsem.0.001930. Epub 2017 Jul 3.
6
Classifying dextrans and levans from sugar crop processing microbial isolates with FTIR spectroscopy, machine learning and genomics.利用傅里叶变换红外光谱、机器学习和基因组学对糖料作物加工微生物分离株中的葡聚糖和果聚糖进行分类。
J Sci Food Agric. 2025 Aug 15. doi: 10.1002/jsfa.70125.
7
Cold induced expression of a novel levansucrase gene sacB1 enhances exopolysaccharide production and stress resilience in Leuconostoc mesenteroides.冷诱导新型果聚糖蔗糖酶基因sacB1的表达可增强嗜温明串珠菌的胞外多糖产生及应激恢复能力。
Sci Rep. 2025 Jul 2;15(1):22980. doi: 10.1038/s41598-025-04141-x.
8
Comparative genome analysis provides shreds of molecular evidence for reclassification of Leuconostoc mesenteroides MTCC 10508 as a strain of Leu. suionicum.比较基因组分析为将嗜温明串珠菌MTCC 10508重新分类为猪源明串珠菌菌株提供了分子证据。
Genomics. 2020 Nov;112(6):4023-4031. doi: 10.1016/j.ygeno.2020.06.040. Epub 2020 Jul 1.
9
Phylogenetic analysis of Leuconostoc and Lactobacillus species isolated from sugarcane processing streams.从甘蔗加工流中分离的肠球菌属和乳杆菌属的系统发育分析。
Microbiologyopen. 2020 Aug;9(8):e1065. doi: 10.1002/mbo3.1065. Epub 2020 Jun 4.
10
sp. nov., a new species associating with sugar beet root rot in Heilongjiang Province, China.新种，一种与中国黑龙江省甜菜根腐病相关的新物种。
Front Microbiol. 2025 Feb 26;16:1453460. doi: 10.3389/fmicb.2025.1453460. eCollection 2025.

本文引用的文献

1
Galaxy @Sciensano: a comprehensive bioinformatics portal for genomics-based microbial typing, characterization, and outbreak detection.Galaxy @Sciensano：一个基于基因组学的微生物分型、特征描述和疫情检测的综合生物信息学门户。
BMC Genomics. 2025 Jan 8;26(1):20. doi: 10.1186/s12864-024-11182-5.
2
Continental-scale insights into the sugarbeet diffusion juice microbiomes.从大陆尺度上深入了解糖甜菜扩散汁微生物组。
Microbiol Spectr. 2024 Nov 5;12(11):e0109324. doi: 10.1128/spectrum.01093-24. Epub 2024 Sep 23.
3
The Galaxy platform for accessible, reproducible, and collaborative data analyses: 2024 update.Galaxy 平台，用于可访问、可重现和协作的数据分析：2024 年更新。
Nucleic Acids Res. 2024 Jul 5;52(W1):W83-W94. doi: 10.1093/nar/gkae410.
4
GTDB-Tk: a toolkit to classify genomes with the Genome Taxonomy Database.GTDB-Tk：一个使用基因组分类数据库对基因组进行分类的工具包。
Bioinformatics. 2019 Nov 15;36(6):1925-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btz848.
5
TYGS is an automated high-throughput platform for state-of-the-art genome-based taxonomy.TYGS 是一个自动化的高通量平台，用于最先进的基于基因组的分类学。
Nat Commun. 2019 May 16;10(1):2182. doi: 10.1038/s41467-019-10210-3.
6
fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor.fastp：一个超快速的一体化 FASTQ 预处理程序。
Bioinformatics. 2018 Sep 1;34(17):i884-i890. doi: 10.1093/bioinformatics/bty560.
7
Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG.QUAST-LG 进行多功能基因组组装评估。
Bioinformatics. 2018 Jul 1;34(13):i142-i150. doi: 10.1093/bioinformatics/bty266.
8
Unicycler: Resolving bacterial genome assemblies from short and long sequencing reads.单轮循环器：从短读长和长读长测序数据中解析细菌基因组组装结果
PLoS Comput Biol. 2017 Jun 8;13(6):e1005595. doi: 10.1371/journal.pcbi.1005595. eCollection 2017 Jun.
9
NCBI prokaryotic genome annotation pipeline.美国国立生物技术信息中心原核生物基因组注释管道
Nucleic Acids Res. 2016 Aug 19;44(14):6614-24. doi: 10.1093/nar/gkw569. Epub 2016 Jun 24.
10
CheckM: assessing the quality of microbial genomes recovered from isolates, single cells, and metagenomes.CheckM：评估从分离株、单细胞和宏基因组中获得的微生物基因组质量。
Genome Res. 2015 Jul;25(7):1043-55. doi: 10.1101/gr.186072.114. Epub 2015 May 14.