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四方晶系溶菌酶晶体结构中的阳离子-π(Na⁺-色氨酸)相互作用。

Cation-pi (Na+-Trp) interactions in the crystal structure of tetragonal lysozyme.

作者信息

Wouters J

机构信息

Facultés Universitaires N.-D. de la Paix, Namur, Belgium.

出版信息

Protein Sci. 1998 Nov;7(11):2472-5. doi: 10.1002/pro.5560071127.

Abstract

Experimental evidence of a cation-pi interaction between a sodium cation (Na+) and the indole ring of residue Trp123 in a structure (2.0 A) of hen egg-white lysozyme is presented. The geometry of the metal ion-pi interaction observed in the protein structure (distance between the aromatic plane and the cation approximately 4 A) is consistent with geometries observed among small molecules crystal structures and quantum chemistry ab initio calculations. The present crystal structure of lysozyme provides unique structural information about the geometry of binding of cations to pi systems in proteins. It shows that the metal ion-pi interaction within proteins is not significantly different from similar bindings found in small molecules and that it can be modeled by theoretical methods.

摘要

本文给出了钠阳离子(Na⁺)与蛋清溶菌酶结构(2.0 Å)中残基Trp123的吲哚环之间存在阳离子-π相互作用的实验证据。在蛋白质结构中观察到的金属离子-π相互作用的几何结构(芳香平面与阳离子之间的距离约为4 Å)与小分子晶体结构和量子化学从头计算中观察到的几何结构一致。溶菌酶目前的晶体结构提供了关于阳离子与蛋白质中π体系结合几何结构的独特结构信息。它表明蛋白质中的金属离子-π相互作用与小分子中发现的类似结合没有显著差异,并且可以通过理论方法进行建模。

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