• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

泉古菌门小亚基核糖体RNA基因序列的定量测定

Quantitative measure of small-subunit rRNA gene sequences of the kingdom korarchaeota.

作者信息

Brunk CF, Eis N

机构信息

Lehrstuhl fur Mikrobiologie und Archaeenzentrum der Universitat Regensburg, Regensburg, Germany.

出版信息

Appl Environ Microbiol. 1998 Dec;64(12):5064-6. doi: 10.1128/AEM.64.12.5064-5066.1998.

DOI:10.1128/AEM.64.12.5064-5066.1998
PMID:9835612
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC90972/
Abstract

Comparative PCR amplification of small-subunit (SSU) rRNA gene (rDNA) sequences indicates substantial preferential PCR amplification of pJP27 sequences with korarchaeote-specific PCR primers. The coamplification of a modified SSU rDNA sequence can be used as an internal standard to determine the amount of a specific SSU rDNA sequence.

摘要

小亚基（SSU）核糖体RNA基因（rDNA）序列的比较性聚合酶链反应（PCR）扩增表明，使用泉古菌特异性PCR引物时，pJP27序列存在显著的优先PCR扩增。修饰的SSU rDNA序列的共扩增可用作内标，以确定特定SSU rDNA序列的量。

相似文献

1
Quantitative measure of small-subunit rRNA gene sequences of the kingdom korarchaeota.泉古菌门小亚基核糖体RNA基因序列的定量测定
Appl Environ Microbiol. 1998 Dec;64(12):5064-6. doi: 10.1128/AEM.64.12.5064-5066.1998.
2
Eukaryotic diversity and phylogeny using small- and large-subunit ribosomal RNA genes from environmental samples.利用环境样本中的小亚基和大亚基核糖体 RNA 基因研究真核生物多样性和系统发育。
Environ Microbiol. 2009 Dec;11(12):3179-88. doi: 10.1111/j.1462-2920.2009.02023.x. Epub 2009 Aug 12.
3
Molecular characterization of the myxosporean associated with parasitic encephalitis of farmed Atlantic salmon Salmo salar in Ireland.与爱尔兰养殖大西洋鲑鱼（Salmo salar）寄生性脑炎相关的粘孢子虫的分子特征分析。
Dis Aquat Organ. 1999 Feb 26;35(3):221-33. doi: 10.3354/dao035221.
4
Amplification of mitochondrial small subunit ribosomal DNA of polypores and its potential for phylogenetic analysis.多孔菌线粒体小亚基核糖体 DNA 的扩增及其在系统发育分析中的潜力。
Mycologia. 2002 Sep-Oct;94(5):823-33.
5
Universal Primers for Amplification of Mitochondrial Small Subunit Ribosomal RNA-Encoding Gene in Scleractinian Corals.用于扩增石珊瑚线粒体小亚基核糖体RNA编码基因的通用引物
Mar Biotechnol (NY). 2000 Mar;2(2):146-153. doi: 10.1007/s101269900018.
6
Diversity and abundance of Korarchaeota in terrestrial hot springs of Iceland and Kamchatka.冰岛和堪察加陆上火山温泉中 Korarchaeota 的多样性和丰度。
ISME J. 2010 Mar;4(3):346-56. doi: 10.1038/ismej.2009.126. Epub 2009 Dec 3.
7
Testing the new animal phylogeny: first use of combined large-subunit and small-subunit rRNA gene sequences to classify the protostomes.检验新的动物系统发生：首次使用大亚基和小亚基核糖体RNA基因序列的组合对原口动物进行分类。
Mol Biol Evol. 2002 Mar;19(3):289-301. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a004082.
8
Microbial diversity at 83 degrees C in Calcite Springs, Yellowstone National Park: another environment where the Aquificales and "Korarchaeota" coexist.黄石国家公园方解石泉83摄氏度环境下的微生物多样性：嗜泉栖热菌目与“科拉超古菌门”共存的另一个环境
Extremophiles. 2000 Feb;4(1):61-7. doi: 10.1007/s007920050008.
9
Preferential PCR amplification of parasitic protistan small subunit rDNA from metazoan tissues.后生动物组织中寄生原生生物小亚基核糖体DNA的优先聚合酶链反应扩增
J Eukaryot Microbiol. 2004 May-Jun;51(3):325-32. doi: 10.1111/j.1550-7408.2004.tb00574.x.
10
Analyses of the ribosomal DNA region in Nosema bombycis NIS 001.对家蚕微孢子虫NIS 001核糖体DNA区域的分析。
J Eukaryot Microbiol. 2004 Nov-Dec;51(6):598-604. doi: 10.1111/j.1550-7408.2004.tb00592.x.

引用本文的文献

1
Diversity in the composition of pleural cavity and oral cavity microbiota in different bacterial empyema.不同细菌性脓胸中胸膜腔和口腔微生物群组成的多样性。
Front Microbiol. 2025 Apr 29;16:1566606. doi: 10.3389/fmicb.2025.1566606. eCollection 2025.
2
Where Do Milk Microbes Originate? Traceability of Microbial Community Structure in Raw Milk.牛奶中的微生物源自何处？原料乳中微生物群落结构的溯源
Foods. 2025 Apr 24;14(9):1490. doi: 10.3390/foods14091490.
3
Changes in microbial composition and interaction patterns of female urogenital tract and rectum in response to HPV infection.女性泌尿生殖道和直肠微生物组成及相互作用模式因 HPV 感染而发生的变化。
J Transl Med. 2024 Feb 1;22(1):125. doi: 10.1186/s12967-024-04916-2.
4
Urogenital tract and rectal microbiota composition and its influence on reproductive outcomes in infertile patients.泌尿生殖道和直肠微生物群组成及其对不孕患者生殖结局的影响。
Front Microbiol. 2023 Feb 10;14:1051437. doi: 10.3389/fmicb.2023.1051437. eCollection 2023.
5
Genital Microbiota of Women From Six Ethnic Groups With and Without Human Papillomavirus Infection in Shangri-La, China.中国香格里拉六个人群中 HPV 感染和未感染女性的生殖道微生物组。
Front Cell Infect Microbiol. 2022 Jul 8;12:935068. doi: 10.3389/fcimb.2022.935068. eCollection 2022.
6
Desulfovulcanus ferrireducens gen. nov., sp. nov., a thermophilic autotrophic iron and sulfate-reducing bacterium from subseafloor basalt that grows on akaganéite and lepidocrocite minerals.脱硫孤菌属，新属，一种嗜热自养的铁还原硫酸盐还原菌，来自海底玄武岩，以铁闪锌矿和纤铁矿矿物为生长基质。
Extremophiles. 2022 Feb 21;26(1):13. doi: 10.1007/s00792-022-01263-2.
7
The comparison of microbial communities in thyroid tissues from thyroid carcinoma patients.甲状腺癌患者甲状腺组织中微生物群落的比较。
J Microbiol. 2021 Nov;59(11):988-1001. doi: 10.1007/s12275-021-1271-9. Epub 2021 Oct 6.
8
Is the delivery mode a critical factor for the microbial communities in the meconium?分娩方式是否是胎粪中微生物群落的关键因素？
EBioMedicine. 2019 Nov;49:354-363. doi: 10.1016/j.ebiom.2019.10.045. Epub 2019 Nov 2.
9
An efficient strategy using mers to analyse 16S rRNA sequences.一种使用mers分析16S rRNA序列的有效策略。
Heliyon. 2017 Jul 27;3(7):e00370. doi: 10.1016/j.heliyon.2017.e00370. eCollection 2017 Jul.
10
How conserved are the conserved 16S-rRNA regions?保守的16S - rRNA区域的保守程度如何？
PeerJ. 2017 Feb 28;5:e3036. doi: 10.7717/peerj.3036. eCollection 2017.

本文引用的文献

1
Methanopyrus kandleri: an archaeal methanogen unrelated to all other known methanogens.坎氏甲烷嗜热菌：一种与所有其他已知产甲烷菌无关的古生代产甲烷菌。
Syst Appl Microbiol. 1991;14:346-51. doi: 10.1016/s0723-2020(11)80308-5.
2
Reclassification of the crenarchael orders and families in accordance with 16S rRNA sequence data.根据16S rRNA序列数据对泉古菌目和科进行重新分类。
Int J Syst Bacteriol. 1997 Jul;47(3):657-60. doi: 10.1099/00207713-47-3-657.
3
Quantification of genetically tagged cyanobacteria in Baltic Sea sediment by competitive PCR.通过竞争性聚合酶链反应对波罗的海沉积物中基因标记蓝藻进行定量分析。
Biotechniques. 1997 Mar;22(3):512-8. doi: 10.2144/97223rr02.
4
A pivotal Archaea group.一个关键的古菌群体。
Nature. 1997 Feb 27;385(6619):780. doi: 10.1038/385780a0.
5
Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences.基于环境rRNA序列对古菌多样性、嗜热性和单系性的见解。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1996 Aug 20;93(17):9188-93. doi: 10.1073/pnas.93.17.9188.
6
At the core of the Archaea.在古菌的核心部位。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1996 Aug 20;93(17):8797-9. doi: 10.1073/pnas.93.17.8797.
7
Quantitative competitive polymerase chain reaction for accurate quantitation of HIV DNA and RNA species.用于准确定量HIV DNA和RNA种类的定量竞争性聚合酶链反应。
Biotechniques. 1993 Jan;14(1):70-81.
8
A molecular technique for identification of bacteria using small subunit ribosomal RNA sequences.一种利用小亚基核糖体RNA序列鉴定细菌的分子技术。
Biotechniques. 1994 Jul;17(1):144-6, 148-9.
9
Quantitative PCR and RT-PCR in virology.病毒学中的定量PCR和逆转录PCR
PCR Methods Appl. 1993 Feb;2(3):191-6. doi: 10.1101/gr.2.3.191.
10
Identifying members of the domain Archaea with rRNA-targeted oligonucleotide probes.使用靶向rRNA的寡核苷酸探针鉴定古菌域的成员。
Appl Environ Microbiol. 1994 Sep;60(9):3112-9. doi: 10.1128/aem.60.9.3112-3119.1994.