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使用酵母基因组数据库(SGD)分析蛋白质相似性和结构。

Using the Saccharomyces Genome Database (SGD) for analysis of protein similarities and structure.

作者信息

Chervitz S A, Hester E T, Ball C A, Dolinski K, Dwight S S, Harris M A, Juvik G, Malekian A, Roberts S, Roe T, Scafe C, Schroeder M, Sherlock G, Weng S, Zhu Y, Cherry J M, Botstein D

机构信息

Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305-5120, USA.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1999 Jan 1;27(1):74-8. doi: 10.1093/nar/27.1.74.

DOI:10.1093/nar/27.1.74
PMID:9847146
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC148101/
Abstract

The Saccharomyces Genome Database (SGD) collects and organizes information about the molecular biology and genetics of the yeast Saccharomyces cerevisiae. The latest protein structure and comparison tools available at SGD are presented here. With the completion of the yeast sequence and the Caenorhabditis elegans sequence soon to follow, comparison of proteins from complete eukaryotic proteomes will be an extremely powerful way to learn more about a particular protein's structure, its function, and its relationships with other proteins. SGD can be accessed through the World Wide Web at http://genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/

摘要

酵母基因组数据库(SGD)收集并整理有关酿酒酵母分子生物学和遗传学的信息。本文介绍了SGD现有的最新蛋白质结构及比较工具。随着酵母序列的完成以及秀丽隐杆线虫序列即将完成,对来自完整真核生物蛋白质组的蛋白质进行比较,将成为深入了解特定蛋白质结构、功能及其与其他蛋白质关系的极其有效的方法。可通过万维网访问SGD,网址为http://genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/