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酵母基因组数据库(SGD)提供了芽殖酵母蛋白质的生化和结构信息。

Saccharomyces Genome Database (SGD) provides biochemical and structural information for budding yeast proteins.

作者信息

Weng Shuai, Dong Qing, Balakrishnan Rama, Christie Karen, Costanzo Maria, Dolinski Kara, Dwight Selina S, Engel Stacia, Fisk Dianna G, Hong Eurie, Issel-Tarver Laurie, Sethuraman Anand, Theesfeld Chandra, Andrada Rey, Binkley Gail, Lane Christopher, Schroeder Mark, Botstein David, Michael Cherry J

机构信息

Department of Genetics, School of Medicine, Stanford University, Stanford, CA 94305-5120, USA.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2003 Jan 1;31(1):216-8. doi: 10.1093/nar/gkg054.

DOI:10.1093/nar/gkg054
PMID:12519985
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC165501/
Abstract

The Saccharomyces Genome Database (SGD: http://genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/) has recently developed new resources to provide more complete information about proteins from the budding yeast Saccharomyces cerevisiae. The PDB Homologs page provides structural information from the Protein Data Bank (PDB) about yeast proteins and/or their homologs. SGD has also created a resource that utilizes the eMOTIF database for motif information about a given protein. A third new resource is the Protein Information page, which contains protein physical and chemical properties, such as molecular weight and hydropathicity scores, predicted from the translated ORF sequence.

摘要

酵母基因组数据库(SGD:http://genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/)最近开发了新资源,以提供有关芽殖酵母酿酒酵母蛋白质的更完整信息。PDB同源物页面提供了来自蛋白质数据库(PDB)的关于酵母蛋白质和/或其同源物的结构信息。SGD还创建了一个利用eMOTIF数据库获取给定蛋白质基序信息的资源。第三个新资源是蛋白质信息页面,其中包含根据翻译后的开放阅读框序列预测的蛋白质物理和化学性质,如分子量和亲水性得分。