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MetaNetter：高分辨率代谢组学网络的推断与可视化

MetaNetter: inference and visualization of high-resolution metabolomic networks.

作者信息

Jourdan Fabien, Breitling Rainer, Barrett Michael P, Gilbert David

机构信息

UMR1089 Xénobiotiques INRA-ENVT, 180 chemin de Tournefeuille, St-Martin-du-Touch, BP3 31931 Toulouse, France.

出版信息

Bioinformatics. 2008 Jan 1;24(1):143-5. doi: 10.1093/bioinformatics/btm536. Epub 2007 Nov 14.

DOI:10.1093/bioinformatics/btm536
PMID:18003642
Abstract

SUMMARY

We present a Cytoscape plugin for the inference and visualization of networks from high-resolution mass spectrometry metabolomic data. The software also provides access to basic topological analysis. This open source, multi-platform software has been successfully used to interpret metabolomic experiments and will enable others using filtered, high mass accuracy mass spectrometric data sets to build and analyse networks.

AVAILABILITY

http://compbio.dcs.gla.ac.uk/fabien/abinitio/abinitio.html

摘要

摘要

我们展示了一种用于从高分辨率质谱代谢组学数据推断和可视化网络的Cytoscape插件。该软件还提供基本拓扑分析功能。这种开源的多平台软件已成功用于解释代谢组学实验，并将使其他使用经过筛选的高质量精度质谱数据集的人员能够构建和分析网络。

可用性

http://compbio.dcs.gla.ac.uk/fabien/abinitio/abinitio.html

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