• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

人类基因突变数据库(HGMD)及其在突变机制研究中的应用。

The Human Gene Mutation Database (HGMD) and its exploitation in the study of mutational mechanisms.

作者信息

Cooper David N, Stenson Peter D, Chuzhanova Nadia A

机构信息

Cardiff University, Cardiff, United Kingdom.

出版信息

Curr Protoc Bioinformatics. 2006 Jan;Chapter 1:Unit 1.13. doi: 10.1002/0471250953.bi0113s12.

DOI:10.1002/0471250953.bi0113s12
PMID:18428754
Abstract

The Human Gene Mutation Database (HGMD) constitutes a comprehensive core collection of data on germ-line mutations in nuclear genes underlying or associated with human inherited disease (http://www.hgmd.org). Data cataloged include single base-pair substitutions in coding, regulatory, and splicing-relevant regions, microdeletions and microinsertions, indels, and triplet repeat expansions, as well as gross gene deletions, insertions, duplications, and complex rearrangements. Each mutation is entered into HGMD only once, in order to avoid confusion between recurrent and identical-by-descent lesions. By June 2005, the database contained in excess of 53,000 different lesions detected in 2029 different nuclear genes, with new entries currently accumulating at a rate in excess of 5000 per annum. HGMD includes cDNA reference sequences, now provided for more than 90% of the listed genes, splice junction data, disease-associated and functional polymorphisms, and links to data present in publicly available online locus-specific mutation databases.

摘要

人类基因突变数据库(HGMD)构成了一个关于人类遗传性疾病相关核基因种系突变数据的综合核心集合(http://www.hgmd.org)。编目的数据包括编码区、调控区和剪接相关区域的单碱基对替换、微缺失和微插入、插入缺失、三联体重复扩增,以及大片段基因缺失、插入、重复和复杂重排。每个突变仅在HGMD中录入一次,以避免复发性病变和同源性相同病变之间的混淆。到2005年6月,该数据库包含在2029个不同核基因中检测到的超过53000种不同病变,目前新条目每年以超过5000条的速度积累。HGMD包括cDNA参考序列(目前已为90%以上列出的基因提供)、剪接位点数据、疾病相关和功能多态性,以及与公开可用的在线位点特异性突变数据库中数据的链接。

相似文献

1
The Human Gene Mutation Database (HGMD) and its exploitation in the study of mutational mechanisms.人类基因突变数据库(HGMD)及其在突变机制研究中的应用。
Curr Protoc Bioinformatics. 2006 Jan;Chapter 1:Unit 1.13. doi: 10.1002/0471250953.bi0113s12.
2
Human Gene Mutation Database (HGMD): 2003 update.人类基因突变数据库(HGMD):2003年更新版。
Hum Mutat. 2003 Jun;21(6):577-81. doi: 10.1002/humu.10212.
3
The Human Gene Mutation Database (HGMD) and its exploitation in the fields of personalized genomics and molecular evolution.人类基因突变数据库(HGMD)及其在个性化基因组学和分子进化领域的应用。
Curr Protoc Bioinformatics. 2012 Sep;Chapter 1:1.13.1-1.13.20. doi: 10.1002/0471250953.bi0113s39.
4
Human mutation databases.人类突变数据库。
Curr Protoc Bioinformatics. 2005 Apr;Chapter 1:Unit 1.10. doi: 10.1002/0471250953.bi0110s9.
5
The human gene mutation database.人类基因突变数据库。
Nucleic Acids Res. 1998 Jan 1;26(1):285-7. doi: 10.1093/nar/26.1.285.
6
Using the Ensembl genome server to browse genomic sequence data.使用Ensembl基因组服务器浏览基因组序列数据。
Curr Protoc Bioinformatics. 2007 Jan;Chapter 1:Unit 1.15. doi: 10.1002/0471250953.bi0115s16.
7
SNP Function Portal: a web database for exploring the function implication of SNP alleles.单核苷酸多态性(SNP)功能门户:一个用于探索SNP等位基因功能含义的网络数据库。
Bioinformatics. 2006 Jul 15;22(14):e523-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btl241.
8
Visualization of genomic aberrations using Affymetrix SNP arrays.使用Affymetrix SNP阵列对基因组畸变进行可视化分析。
Bioinformatics. 2007 Feb 15;23(4):496-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btl608. Epub 2006 Nov 30.
9
The Human Gene Mutation Database: building a comprehensive mutation repository for clinical and molecular genetics, diagnostic testing and personalized genomic medicine.人类基因突变数据库:为临床和分子遗传学、诊断测试以及个性化基因组医学构建全面的基因突变知识库。
Hum Genet. 2014 Jan;133(1):1-9. doi: 10.1007/s00439-013-1358-4.
10
SNP@Promoter: a database of human SNPs (single nucleotide polymorphisms) within the putative promoter regions.SNP@启动子:一个关于假定启动子区域内人类单核苷酸多态性(SNP)的数据库。
BMC Bioinformatics. 2008;9 Suppl 1(Suppl 1):S2. doi: 10.1186/1471-2105-9-S1-S2.

引用本文的文献

1
Cell Modeling and Rescue of a Novel Non-coding Genetic Cause of Glycogen Storage Disease IX.糖原贮积病IX型一种新型非编码遗传病因的细胞建模与挽救
bioRxiv. 2025 May 17:2025.05.14.654043. doi: 10.1101/2025.05.14.654043.
2
Variant Impact Predictor database (VIPdb), version 2: trends from three decades of genetic variant impact predictors.变异影响预测器数据库(VIPdb),版本 2:三十年来遗传变异影响预测器的趋势。
Hum Genomics. 2024 Aug 28;18(1):90. doi: 10.1186/s40246-024-00663-z.
3
Variant Impact Predictor database (VIPdb), version 2: Trends from 25 years of genetic variant impact predictors.
变异影响预测数据库(VIPdb),版本2:25年基因变异影响预测的趋势
bioRxiv. 2024 Jun 28:2024.06.25.600283. doi: 10.1101/2024.06.25.600283.
4
Dermokine mutations contribute to epithelial-mesenchymal transition and advanced melanoma through ERK/MAPK pathways.Dermokine 突变通过 ERK/MAPK 通路促进上皮-间充质转化和晚期黑色素瘤。
PLoS One. 2023 Jul 11;18(7):e0285806. doi: 10.1371/journal.pone.0285806. eCollection 2023.
5
The molecular biology of tubulinopathies: Understanding the impact of variants on tubulin structure and microtubule regulation.微管蛋白病的分子生物学:了解变异对微管蛋白结构和微管调节的影响。
Front Cell Neurosci. 2022 Nov 2;16:1023267. doi: 10.3389/fncel.2022.1023267. eCollection 2022.
6
Comparative analysis of web-based programs for single amino acid substitutions in proteins.蛋白质中单氨基酸替换的基于网络程序的比较分析。
PLoS One. 2022 May 4;17(5):e0267084. doi: 10.1371/journal.pone.0267084. eCollection 2022.
7
Cardio-pathogenic variants in unexplained intrauterine fetal death: a retrospective pilot study.不明原因的宫内胎儿死亡中的心脏病变变体:一项回顾性试点研究。
Sci Rep. 2021 Mar 24;11(1):6737. doi: 10.1038/s41598-021-85893-0.
8
Distinct placental molecular processes associated with early-onset and late-onset preeclampsia.与早发型和晚发型子痫前期相关的胎盘分子过程不同。
Theranostics. 2021 Mar 5;11(10):5028-5044. doi: 10.7150/thno.56141. eCollection 2021.
9
An Automated Functional Annotation Pipeline That Rapidly Prioritizes Clinically Relevant Genes for Autism Spectrum Disorder.一种自动化的功能注释管道,可快速确定自闭症谱系障碍相关的临床基因。
Int J Mol Sci. 2020 Nov 27;21(23):9029. doi: 10.3390/ijms21239029.
10
A decision tree to improve identification of pathogenic mutations in clinical practice.一种有助于在临床实践中提高致病性突变识别能力的决策树。
BMC Med Inform Decis Mak. 2020 Mar 10;20(1):52. doi: 10.1186/s12911-020-1060-0.