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工程基因回路中的连续计算

Continuous computation in engineered gene circuits.

作者信息

Goñi-Moreno Angel, Amos Martyn

机构信息

School of Computing, Mathematics and Digital Technology, Manchester Metropolitan University, United Kingdom.

出版信息

Biosystems. 2012 Jul;109(1):52-6. doi: 10.1016/j.biosystems.2012.02.001. Epub 2012 Feb 23.

DOI:10.1016/j.biosystems.2012.02.001
PMID:22387968
Abstract

In this paper we consider the problem of representation and measurement in genetic circuits, and investigate how they can affect the reliability of engineered systems. We propose a design scheme, based on the notion of continuous computation, which addresses these issues. We illustrate the methodology by showing how a concept from computer architecture (namely, branch prediction) may be implemented in vivo, using a distributed approach. Simulation results confirm the in-principle feasibility of our method, and offer valuable insights into its future laboratory validation.

摘要

在本文中,我们考虑了基因回路中的表示和测量问题,并研究了它们如何影响工程系统的可靠性。我们基于连续计算的概念提出了一种设计方案,以解决这些问题。我们通过展示计算机体系结构中的一个概念(即分支预测)如何使用分布式方法在体内实现来说明该方法。仿真结果证实了我们方法在原理上的可行性,并为其未来的实验室验证提供了有价值的见解。

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