• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

开源药物发现——一个有限的教程。

Open source drug discovery - a limited tutorial.

机构信息

School of Chemistry, The University of Sydney, Sydney, NSW 2006, Australia.

Medicines for Malaria Venture, PO Box 1826, 20 rte de Pré-Bois, 1215 Geneva 15, Switzerland.

出版信息

Parasitology. 2014 Jan;141(1):148-57. doi: 10.1017/S0031182013001121. Epub 2013 Aug 28.

DOI:10.1017/S0031182013001121
PMID:23985301
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3884843/
Abstract

Open science is a new concept for the practice of experimental laboratory-based research, such as drug discovery. The authors have recently gained experience in how to run such projects and here describe some straightforward steps others may wish to take towards more openness in their own research programmes. Existing and inexpensive online tools can solve many challenges, while some psychological barriers to the free sharing of all data and ideas are more substantial.

摘要

开放科学是实验性实验室研究(如药物发现)实践的新概念。作者最近在如何开展此类项目方面获得了经验,在此介绍其他人在其研究计划中实现更高透明度的一些简单步骤。现有的、廉价的在线工具可以解决许多挑战,而对于免费共享所有数据和想法的一些心理障碍则更为严重。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/6822f3dae396/S0031182013001121_fig6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/e7e69b5a7b16/S0031182013001121_fig1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/12ecbf71bfd0/S0031182013001121_fig2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/32e3e56cf604/S0031182013001121_fig3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/202eda9ee29a/S0031182013001121_fig4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/1c99e61b3f67/S0031182013001121_fig5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/6822f3dae396/S0031182013001121_fig6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/e7e69b5a7b16/S0031182013001121_fig1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/12ecbf71bfd0/S0031182013001121_fig2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/32e3e56cf604/S0031182013001121_fig3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/202eda9ee29a/S0031182013001121_fig4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/1c99e61b3f67/S0031182013001121_fig5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/529c/3884843/6822f3dae396/S0031182013001121_fig6.jpg

相似文献

1
Open source drug discovery - a limited tutorial.开源药物发现——一个有限的教程。
Parasitology. 2014 Jan;141(1):148-57. doi: 10.1017/S0031182013001121. Epub 2013 Aug 28.
2
Using an open source model to accelerate schistosomiasis drug research.利用开源模型加速血吸虫病药物研究。
Future Med Chem. 2015;7(6):689-92. doi: 10.4155/fmc.15.28.
3
How has the genomics era impacted schistosomiasis drug discovery?基因组学时代对血吸虫病药物研发有何影响?
Future Med Chem. 2015;7(6):685-7. doi: 10.4155/fmc.15.30.
4
Collection, verification, sharing and dissemination of data: the CONTRAST experience.数据的收集、验证、共享和传播:CONTRAST 经验。
Acta Trop. 2013 Nov;128(2):407-11. doi: 10.1016/j.actatropica.2013.05.008. Epub 2013 May 22.
5
Target-based molecular modeling strategies for schistosomiasis drug discovery.用于血吸虫病药物研发的基于靶点的分子建模策略。
Future Med Chem. 2015;7(6):753-64. doi: 10.4155/fmc.15.21.
6
Schistosomiasis and its treatment.血吸虫病及其治疗
Future Med Chem. 2015;7(6):675-6. doi: 10.4155/fmc.15.27.
7
Recent advances in malaria drug discovery.疟疾药物发现的最新进展。
Bioorg Med Chem Lett. 2013 May 15;23(10):2829-43. doi: 10.1016/j.bmcl.2013.03.067. Epub 2013 Mar 27.
8
Open Source Drug Discovery with the Malaria Box Compound Collection for Neglected Diseases and Beyond.利用疟疾盒化合物库开展针对被忽视疾病及其他疾病的开源药物研发。
PLoS Pathog. 2016 Jul 28;12(7):e1005763. doi: 10.1371/journal.ppat.1005763. eCollection 2016 Jul.
9
Data disclosure and data sharing in scientific research.科学研究中的数据披露与数据共享。
Account Res. 1992;2(2):93-132. doi: 10.1080/08989629208573808.
10
Imidazole: An Essential Edifice for the Identification of New Lead Compounds and Drug Development.咪唑:新型先导化合物鉴定与药物研发的关键基石。
Mini Rev Med Chem. 2018;18(2):142-163. doi: 10.2174/1389557517666170228113656.

引用本文的文献

1
Professors want to share: preliminary survey results on establishing open-source-endowed professorships.教授们希望分享:关于设立开源资助教授职位的初步调查结果。
SN Soc Sci. 2022;2(10):203. doi: 10.1007/s43545-022-00524-3. Epub 2022 Sep 21.
2
What incentives increase data sharing in health and medical research? A systematic review.哪些激励措施能促进健康与医学研究中的数据共享?一项系统综述。
Res Integr Peer Rev. 2017 May 5;2:4. doi: 10.1186/s41073-017-0028-9. eCollection 2017.
3
Experiences with a researcher-centric ELN.以研究者为中心的电子实验室笔记本的经验。

本文引用的文献

1
The open access malaria box: a drug discovery catalyst for neglected diseases.开放获取疟疾盒子:用于治疗被忽视疾病的药物发现催化剂。
PLoS One. 2013 Jun 17;8(6):e62906. doi: 10.1371/journal.pone.0062906. Print 2013.
2
Net present value approaches for drug discovery.药物研发的净现值方法。
Springerplus. 2013 Apr 1;2(1):140. doi: 10.1186/2193-1801-2-140. Print 2013 Dec.
3
Licence restrictions: A fool's errand.许可限制:徒劳无功之事。
Chem Sci. 2015 Mar 1;6(3):1614-1629. doi: 10.1039/c4sc02128b. Epub 2014 Oct 20.
4
Imagining the "open" university: Sharing scholarship to improve research and education.畅想“开放”大学:分享学术成果以提升研究与教育水平。
PLoS Biol. 2017 Oct 24;15(10):e1002614. doi: 10.1371/journal.pbio.1002614. eCollection 2017 Oct.
5
Is Open Science the Future of Drug Development?开放科学是药物研发的未来吗?
Yale J Biol Med. 2017 Mar 29;90(1):147-151. eCollection 2017 Mar.
6
Open Source Drug Discovery: Highly Potent Antimalarial Compounds Derived from the Tres Cantos Arylpyrroles.开源药物发现:源自特雷斯坎托斯芳基吡咯的高效抗疟化合物。
ACS Cent Sci. 2016 Oct 26;2(10):687-701. doi: 10.1021/acscentsci.6b00086. Epub 2016 Sep 14.
7
Open drug discovery for the Zika virus.寨卡病毒的开放式药物研发
F1000Res. 2016 Feb 9;5:150. doi: 10.12688/f1000research.8013.1. eCollection 2016.
8
Open access target validation is a more efficient way to accelerate drug discovery.开放获取的靶点验证是加速药物研发的更有效方式。
PLoS Biol. 2015 Jun 4;13(6):e1002164. doi: 10.1371/journal.pbio.1002164. eCollection 2015 Jun.
9
Efficient Synthesis and Anti-Tubercular Activity of a Series of Spirocycles: An Exercise in Open Science.一系列螺环化合物的高效合成及其抗结核活性:开放科学实践
PLoS One. 2014 Dec 10;9(12):e111782. doi: 10.1371/journal.pone.0111782. eCollection 2014.
10
Parallel worlds of public and commercial bioactive chemistry data.公共和商业生物活性化学数据的平行世界。
J Med Chem. 2015 Mar 12;58(5):2068-76. doi: 10.1021/jm5011308. Epub 2014 Dec 4.
Nature. 2013 Mar 28;495(7442):440-1. doi: 10.1038/495440a.
4
Git can facilitate greater reproducibility and increased transparency in science.Git有助于提高科学研究的可重复性和透明度。
Source Code Biol Med. 2013 Feb 28;8(1):7. doi: 10.1186/1751-0473-8-7.
5
InChI in the wild: an assessment of InChIKey searching in Google.野外 InChI:对 Google 中 InChIKey 搜索的评估。
J Cheminform. 2013 Feb 11;5(1):10. doi: 10.1186/1758-2946-5-10.
6
Open Drug Discovery Teams: A Chemistry Mobile App for Collaboration.开放式药物发现团队:一款用于协作的化学移动应用程序。
Mol Inform. 2012 Aug;31(8):585-597. doi: 10.1002/minf.201200034. Epub 2012 Aug 6.
7
Open source drug discovery in practice: a case study.开源药物研发实践:案例研究。
PLoS Negl Trop Dis. 2012;6(9):e1827. doi: 10.1371/journal.pntd.0001827. Epub 2012 Sep 20.
8
Why open drug discovery needs four simple rules for licensing data and models.为什么开放药物研发需要许可数据和模型的四条简单规则。
PLoS Comput Biol. 2012;8(9):e1002706. doi: 10.1371/journal.pcbi.1002706. Epub 2012 Sep 27.
9
Absence of detectable arsenate in DNA from arsenate-grown GFAJ-1 cells.未在亚砷酸盐生长的 GFAJ-1 细胞的 DNA 中检测到可检出的砷酸盐。
Science. 2012 Jul 27;337(6093):470-3. doi: 10.1126/science.1219861. Epub 2012 Jul 8.
10
Open science versus commercialization: a modern research conflict?开放科学与商业化:现代研究的冲突?
Genome Med. 2012 Feb 27;4(2):17. doi: 10.1186/gm316.