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新基因组的分类归属应使用平均核苷酸同一性和多位点系统发育分析来验证。

Taxonomic affiliation of new genomes should be verified using average nucleotide identity and multilocus phylogenetic analysis.

作者信息

Figueras María José, Beaz-Hidalgo Roxana, Hossain Mohammad J, Liles Mark R

机构信息

Unitat de Microbiologia, Departament de Ciènces Médiques Bàsiques, Facultat de Medicina i Ciències de la Salut, IISPV, Universitat Rovira i Virgili, Reus, Spain

Unitat de Microbiologia, Departament de Ciènces Médiques Bàsiques, Facultat de Medicina i Ciències de la Salut, IISPV, Universitat Rovira i Virgili, Reus, Spain.

出版信息

Genome Announc. 2014 Dec 4;2(6):e00927-14. doi: 10.1128/genomeA.00927-14.

Abstract

The average nucleotide identity (ANI) determines if two genomes belong to the same species. Using ANI, we detected mislabeled genomes and recommend verifying with ANI and multilocus phylogenetic analysis the species affiliations of the announced genomes. The slightly different results obtained with different ANI calculation software can potentially mislead taxonomic inferences.

摘要

平均核苷酸一致性(ANI)可确定两个基因组是否属于同一物种。通过使用ANI,我们检测到了标记错误的基因组,并建议通过ANI和多位点系统发育分析来验证已公布基因组的物种归属。使用不同的ANI计算软件获得的略有不同的结果可能会误导分类学推断。

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