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在秘鲁分离出的首例产新型德里金属β-内酰胺酶（NDM-1）的大肠杆菌菌株的基因组序列草图

Draft Genome Sequence of the First New Delhi Metallo-β-Lactamase (NDM-1)-Producing Escherichia coli Strain Isolated in Peru.

作者信息

Tamariz Jesus, Llanos Carlos, Seas Carlos, Montenegro Paola, Lagos Jose, Fernandes Miriam R, Cerdeira Louise, Lincopan Nilton

机构信息

Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru

Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru.

出版信息

Genome Announc. 2018 Mar 29;6(13):e00199-18. doi: 10.1128/genomeA.00199-18.

DOI:10.1128/genomeA.00199-18
PMID:29599159
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5876490/
Abstract

We present here the draft genome sequence of the first New Delhi metallo-β-lactamase (NDM-1)-producing strain, belonging to sequence type 155 (ST155), isolated in Peru. Assembly of this draft genome resulted in 5,061,184 bp, revealing a clinically significant resistome for β-lactams, aminoglycosides, tetracyclines, phenicols, sulfonamides, trimethoprim, and fluoroquinolones.

摘要

我们在此展示在秘鲁分离出的第一株产新德里金属β-内酰胺酶（NDM-1）的菌株的基因组序列草图，该菌株属于序列型155（ST155）。该基因组草图的组装产生了5,061,184个碱基对，揭示了对β-内酰胺类、氨基糖苷类、四环素类、酚类、磺胺类、甲氧苄啶和氟喹诺酮类具有临床意义的耐药基因组。