• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基于基因组数据对哈萨克斯坦两起炭疽疫情之间关系的回顾性分析。

Retrospective Analysis of the Relationship between Two Anthrax Outbreaks in Kazakhstan Based on Genomic Data.

作者信息

Shevtsov Alexandr, Vergnaud Gilles, Amirgazin Asylulan, Lukhnova Larissa, Izbanova Uinkul, Shevtsov Vladislav, Ramankulov Yerlan

机构信息

National Center for Biotechnology, Nur-Sultan, Kazakhstan

Université Paris-Saclay, Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC), Gif-sur-Yvette, France.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2020 Dec 10;9(50):e01126-20. doi: 10.1128/MRA.01126-20.

DOI:10.1128/MRA.01126-20
PMID:33303664
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7729412/
Abstract

We present a retrospective analysis of strains from two anthrax outbreaks in western Kazakhstan in 2009. The outbreaks occurred during the same period and in the same area located close to main roads, favoring a single source of infection. However, multilocus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA), canonical single-nucleotide polymorphism (CanSNP) analysis, and genome-wide analysis demonstrated that the outbreaks were not connected.

摘要

我们对2009年哈萨克斯坦西部两次炭疽疫情的菌株进行了回顾性分析。两次疫情发生在同一时期,且在靠近主要道路的同一区域,这表明可能存在单一传染源。然而,多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)、典型单核苷酸多态性(CanSNP)分析和全基因组分析表明,这两次疫情并无关联。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f7e4/7729412/d48cd7f00ad9/MRA.01126-20-f0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f7e4/7729412/d48cd7f00ad9/MRA.01126-20-f0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f7e4/7729412/d48cd7f00ad9/MRA.01126-20-f0001.jpg

相似文献

1
Retrospective Analysis of the Relationship between Two Anthrax Outbreaks in Kazakhstan Based on Genomic Data.基于基因组数据对哈萨克斯坦两起炭疽疫情之间关系的回顾性分析。
Microbiol Resour Announc. 2020 Dec 10;9(50):e01126-20. doi: 10.1128/MRA.01126-20.
2
Genetic diversity of Bacillus anthracis Ames lineage strains in China.中国炭疽杆菌安姆斯谱系菌株的遗传多样性。
BMC Infect Dis. 2020 Feb 14;20(1):140. doi: 10.1186/s12879-020-4867-5.
3
Genetic source tracking of an anthrax outbreak in Shaanxi province, China.中国陕西省炭疽疫情的基因溯源
Infect Dis Poverty. 2017 Jan 17;6(1):14. doi: 10.1186/s40249-016-0218-6.
4
Genotyping and phylogenetic placement of Bacillus anthracis isolates from Finland, a country with rare anthrax cases.对来自芬兰(炭疽病罕见的国家)的炭疽芽胞杆菌分离株进行基因分型和系统发育定位。
BMC Microbiol. 2018 Sep 3;18(1):102. doi: 10.1186/s12866-018-1250-4.
5
Genetic characteristics of Bacillus anthracis isolated from northwestern China from 1990 to 2016.1990 年至 2016 年中国西北地区分离的炭疽芽孢杆菌的遗传特征。
PLoS Negl Trop Dis. 2018 Nov 12;12(11):e0006908. doi: 10.1371/journal.pntd.0006908. eCollection 2018 Nov.
6
Genotyping and population diversity of Bacillus anthracis in China based on MLVA and canSNP analysis.基于 MLVA 和 canSNP 分析的中国炭疽芽孢杆菌的基因分型和种群多样性。
Microbiol Res. 2020 Mar;233:126414. doi: 10.1016/j.micres.2020.126414. Epub 2020 Jan 15.
7
Anthrax phylogenetic structure in Northern Italy.
BMC Res Notes. 2011 Jul 29;4:273. doi: 10.1186/1756-0500-4-273.
8
Phylogenetic Characteristics of Anthrax Outbreaks in Liaoning Province, China, 2001-2015.2001 - 2015年中国辽宁省炭疽疫情的系统发育特征
PLoS One. 2016 Jun 14;11(6):e0157496. doi: 10.1371/journal.pone.0157496. eCollection 2016.
9
Effective Surveillance Using Multilocus Variable-Number Tandem-Repeat Analysis and Whole-Genome Sequencing for Enterohemorrhagic Escherichia coli O157.采用多位点可变数目串联重复分析和全基因组测序技术对肠出血性大肠杆菌 O157 进行有效监测。
Appl Environ Microbiol. 2019 Aug 14;85(17). doi: 10.1128/AEM.00728-19. Print 2019 Sep 1.
10
Genotype Analysis of Bacillus anthracis Strains Circulating in Bangladesh.孟加拉国流行的炭疽芽孢杆菌菌株的基因型分析。
PLoS One. 2016 Apr 15;11(4):e0153548. doi: 10.1371/journal.pone.0153548. eCollection 2016.

引用本文的文献

1
Epidemiological and molecular analysis of anthrax cases of the Zhambyl region Kazakhstan in 2023.2023年哈萨克斯坦扎姆比勒地区炭疽病例的流行病学和分子分析
Front Public Health. 2025 Jul 28;13:1620930. doi: 10.3389/fpubh.2025.1620930. eCollection 2025.
2
Knowledge, attitude and practice related to anthrax among livestock farmers in West Kazakhstan.哈萨克斯坦西部农牧民对炭疽病的知识、态度和实践。
Vet Med Sci. 2024 Sep;10(5):e1553. doi: 10.1002/vms3.1553.
3
Phylogeography: New Clues From Kazakhstan, Central Asia.系统发育地理学:来自中亚哈萨克斯坦的新线索

本文引用的文献

1
Insights from Bacillus anthracis strains isolated from permafrost in the tundra zone of Russia.从俄罗斯冻土地带苔原地区分离的炭疽芽孢杆菌菌株的研究结果。
PLoS One. 2019 May 22;14(5):e0209140. doi: 10.1371/journal.pone.0209140. eCollection 2019.
2
SKESA: strategic k-mer extension for scrupulous assemblies.SKESA:用于严谨组装的策略性 k--mer 扩展。
Genome Biol. 2018 Oct 4;19(1):153. doi: 10.1186/s13059-018-1540-z.
3
A Bacillus anthracis Genome Sequence from the Sverdlovsk 1979 Autopsy Specimens.来自斯维尔德洛夫斯克1979年尸检样本的炭疽杆菌基因组序列。
Front Microbiol. 2021 Dec 8;12:778225. doi: 10.3389/fmicb.2021.778225. eCollection 2021.
mBio. 2016 Sep 27;7(5):e01501-16. doi: 10.1128/mBio.01501-16.
4
NCBI prokaryotic genome annotation pipeline.美国国立生物技术信息中心原核生物基因组注释管道
Nucleic Acids Res. 2016 Aug 19;44(14):6614-24. doi: 10.1093/nar/gkw569. Epub 2016 Jun 24.
5
Genotyping of French Bacillus anthracis strains based on 31-loci multi locus VNTR analysis: epidemiology, marker evaluation, and update of the internet genotype database.基于31个位点的多位点可变数目串联重复序列分析对法国炭疽芽孢杆菌菌株进行基因分型:流行病学、标记评估及互联网基因型数据库更新
PLoS One. 2014 Jun 5;9(6):e95131. doi: 10.1371/journal.pone.0095131. eCollection 2014.
6
CanSNPer: a hierarchical genotype classifier of clonal pathogens.CanSNPer:一种克隆性病原体的层次基因型分类器。
Bioinformatics. 2014 Jun 15;30(12):1762-4. doi: 10.1093/bioinformatics/btu113. Epub 2014 Feb 25.
7
Significance of the identification in the Horn of Africa of an exceptionally deep branching Mycobacterium tuberculosis clade.在非洲之角鉴定出分枝杆菌结核分枝杆菌异常深分支群的意义。
PLoS One. 2012;7(12):e52841. doi: 10.1371/journal.pone.0052841. Epub 2012 Dec 27.
8
Distribution and molecular evolution of bacillus anthracis genotypes in Namibia.纳米比亚炭疽芽孢杆菌基因型的分布与分子进化。
PLoS Negl Trop Dis. 2012;6(3):e1534. doi: 10.1371/journal.pntd.0001534. Epub 2012 Mar 6.
9
PGAP: pan-genomes analysis pipeline.PGAP:泛基因组分析管道。
Bioinformatics. 2012 Feb 1;28(3):416-8. doi: 10.1093/bioinformatics/btr655. Epub 2011 Nov 29.
10
Historical distribution and molecular diversity of Bacillus anthracis, Kazakhstan.哈萨克斯坦炭疽芽孢杆菌的历史分布和分子多样性。
Emerg Infect Dis. 2010 May;16(5):789-96. doi: 10.3201/eid1605.091427.