• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

萝藦科杠柳亚科杠柳属植物的完整质体基因组

Complete plastome genome of L. (Asclepiadoideae, Apocynaceae).

作者信息

Abba Abidina, Alzahrani Dhafer, Yaradua Samaila, Albokhari Enas Bokhari

机构信息

Faculty of Science, Deparment of Biological Sciences, King Abdulazeez University, Jeddah, Saudi Arabia.

Faculty of Science, Deparment of Biological Sciences, Federal University, Lokoja, Nigeria.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Feb 6;5(1):566-567. doi: 10.1080/23802359.2019.1710291.

DOI:10.1080/23802359.2019.1710291
PMID:33366649
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7748634/
Abstract

is a medicinal plant mainly found in Saudi Arabia, northern and southern Africa. In this study, we present the sequence of the complete chloroplast (cp) genome of in order to evaluate the evolutionary relationship in the subfamily Asclepiadoideae. The cp is 164,213 bp in lengh with 37.3% GC content, inverted repeat (IR) regions of 21,411 bp each, a large single-copy (LSC) region of 80,102 bp, and a small single-copy (SSC) region of 17,022 bp. It constitutes of 89 protien-coding genes, 44 tRNA genes, and 8 rRNA genes. The phylogenetic relationship showed close relationship between and other Asclepiadeae members with Marsedineae subtribe. The study will help for future research on evolutionary studies of Apoceanaceae.

摘要

是一种主要分布在沙特阿拉伯、非洲北部和南部的药用植物。在本研究中,我们展示了该植物完整叶绿体(cp)基因组的序列,以评估马利筋亚科的进化关系。该叶绿体基因组长度为164,213 bp,GC含量为37.3%,每个反向重复(IR)区域为21,411 bp,一个大单拷贝(LSC)区域为80,102 bp,一个小单拷贝(SSC)区域为17,022 bp。它由89个蛋白质编码基因、44个tRNA基因和8个rRNA基因组成。系统发育关系表明该植物与马利筋科其他成员以及马利筋亚族之间关系密切。该研究将有助于未来对萝藦科进化研究的开展。 (注:原文中部分植物名称未给出具体中文,这里保留原文未翻译)

相似文献

1
Complete plastome genome of L. (Asclepiadoideae, Apocynaceae).萝藦科杠柳亚科杠柳属植物的完整质体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Feb 6;5(1):566-567. doi: 10.1080/23802359.2019.1710291.
2
Characterization of the complete chloroplast genome of (Apocynaceae: Asclepiadoideae: Asclepiadeae), a rare and threatened liana endemic to China.中国特有的珍稀濒危藤本植物(夹竹桃科:萝摩亚科:马利筋亚科)叶绿体全基因组特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Jul 11;3(2):763-764. doi: 10.1080/23802359.2018.1491340.
3
Complete plastome sequence of Traill and Tsiang (Apocynaceae).Traill和蒋英(夹竹桃科)的完整质体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Oct 26;3(2):1176-1177. doi: 10.1080/23802359.2018.1524720.
4
The complete chloroplast genome of (Acanthaceae).(爵床科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Oct 23;4(2):3729-3730. doi: 10.1080/23802359.2019.1681315.
5
Complete plastome sequence of Blume (Phyllanthaceae): a medicinal shrub species in South Asia.布鲁姆叶下珠(大戟科叶下珠属)的完整质体基因组序列:南亚的一种药用灌木物种
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jul 15;6(8):2330-2331. doi: 10.1080/23802359.2021.1951134. eCollection 2021.
6
Comprehensive Analysis of Chloroplast Genome.叶绿体基因组的综合分析
Plants (Basel). 2019 Apr 4;8(4):89. doi: 10.3390/plants8040089.
7
The complete chloroplast genome of Tomentosa cherry (Prunoideae, Rosaceae).绒毛樱桃(李属,蔷薇科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Jun 11;3(2):672-673. doi: 10.1080/23802359.2018.1476068.
8
Complete chloroplast genome sequence of Barleria prionitis, comparative chloroplast genomics and phylogenetic relationships among Acanthoideae.巴特勒利亚·普里奥尼蒂斯的完整叶绿体基因组序列,Acanthoideae 中的叶绿体基因组比较和系统发育关系。
BMC Genomics. 2020 Jun 6;21(1):393. doi: 10.1186/s12864-020-06798-2.
9
Characterization of the complete chloroplast genome of a medicinal plant, (Thymelaeaceae).一种药用植物(瑞香科)叶绿体全基因组的特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 12;5(1):83-84. doi: 10.1080/23802359.2019.1696249.
10
Complete plastome sequence of (tribe Tordylieae, Apiaceae): a medicinal plant.(伞形科破子草族)一种药用植物的完整质体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Oct 7;4(2):3429-3431. doi: 10.1080/23802359.2019.1674718.

引用本文的文献

1
Medicinal plants used for dermatological disorders among the people of the kingdom of Saudi Arabia: A narrative review.沙特阿拉伯王国人民用于治疗皮肤病的药用植物:一项叙述性综述。
Saudi J Biol Sci. 2022 Jun;29(6):103303. doi: 10.1016/j.sjbs.2022.103303. Epub 2022 Apr 22.
2
Plastome evolution and organisation in the Hoya group (Apocynaceae).质体基因组进化与组织结构在球兰属(夹竹桃科)中的研究。
Sci Rep. 2021 Jul 15;11(1):14520. doi: 10.1038/s41598-021-93890-6.
3
The complete chloroplast genome sequence of (Cleomaceae).(白花菜科)的完整叶绿体基因组序列。

本文引用的文献

1
NOVOPlasty: de novo assembly of organelle genomes from whole genome data.NOVOPlasty:从头组装细胞器基因组的全基因组数据。
Nucleic Acids Res. 2017 Feb 28;45(4):e18. doi: 10.1093/nar/gkw955.
2
tRNAscan-SE On-line: integrating search and context for analysis of transfer RNA genes.tRNAscan-SE在线工具:整合搜索与上下文以分析转运RNA基因
Nucleic Acids Res. 2016 Jul 8;44(W1):W54-7. doi: 10.1093/nar/gkw413. Epub 2016 May 12.
3
The Engineered Chloroplast Genome Just Got Smarter.人工合成的叶绿体基因组变得更智能了。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jun 14;6(7):1909-1910. doi: 10.1080/23802359.2021.1935339.
4
Complete chloroplast genome sequences of and and other Cleomaceae Species, comparative analysis and phylogenetic relationships.[具体植物名称1]和[具体植物名称2]以及其他白花菜科物种的完整叶绿体基因组序列、比较分析和系统发育关系。
Saudi J Biol Sci. 2021 Apr;28(4):2476-2490. doi: 10.1016/j.sjbs.2021.01.049. Epub 2021 Feb 2.
Trends Plant Sci. 2015 Oct;20(10):622-640. doi: 10.1016/j.tplants.2015.07.004.
4
Quality control and preprocessing of metagenomic datasets.宏基因组数据集的质量控制和预处理。
Bioinformatics. 2011 Mar 15;27(6):863-4. doi: 10.1093/bioinformatics/btr026. Epub 2011 Jan 28.
5
Automatic annotation of organellar genomes with DOGMA.使用DOGMA对细胞器基因组进行自动注释。
Bioinformatics. 2004 Nov 22;20(17):3252-5. doi: 10.1093/bioinformatics/bth352. Epub 2004 Jun 4.