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来自中国云南的(单子叶植物纲:百合科)的完整叶绿体基因组。

The complete chloroplast genome of (Liliopsida: Liliaceae) from Yunnan, China.

作者信息

Bai Weiwei, Wu Jingzhi, He Shuilian, Gu Zhijia, Jiang Hui, Wu Hongzhi

机构信息

Yunnan Agricultural University, Kunming, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 15;6(3):855-857. doi: 10.1080/23802359.2021.1885318.

DOI:10.1080/23802359.2021.1885318
PMID:33796656
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7971213/
Abstract

E. H. Wilson ex Sealy is classified in Liliaceae, and it is an important ornamental plant with wonderful rose-red color and pleasant rose fragrance. In this study, we sequenced the complete chloroplast genome of by Illumina Hiseq X Ten and PacBio RS technologies. The genome size of is 152,280 bp, and displays a typical quadripartite structure: one large single-copy (LSC, 81,977 bp), one small single-copy (SSC, 17,539 bp), and a pair of inverted repeat regions (IRs, 26,382 bp). The overall GC content was 37.0%. The complete genome contained 131 genes, including 85 protein-coding genes, 38 tRNA genes, and 8 rRNA genes. Phylogenetic analysis showed that is closely related to and . The present study could afford crucial genetic information for further researches on the genus and related genera.

摘要

由西利引种的威尔逊百合被归类于百合科,它是一种重要的观赏植物,具有迷人的玫瑰红色和宜人的玫瑰香气。在本研究中,我们采用Illumina Hiseq X Ten和PacBio RS技术对其完整叶绿体基因组进行了测序。其基因组大小为152,280 bp,呈现典型的四分体结构:一个大单拷贝区(LSC,81,977 bp)、一个小单拷贝区(SSC,17,539 bp)和一对反向重复区域(IRs,26,382 bp)。总体GC含量为37.0%。完整基因组包含131个基因,包括85个蛋白质编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因。系统发育分析表明,威尔逊百合与[具体物种1]和[具体物种2]密切相关。本研究可为该属及相关属的进一步研究提供关键的遗传信息。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f651/7971213/7ebbfba1f0b5/TMDN_A_1885318_F0001_B.jpg
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