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sp. nov.,分离自地中海海洋铝残余物。

sp. nov., isolated from marine aluminium residues from the Mediterranean sea.

机构信息

Institute for Integrative Systems Biology I2SysBio (Universitat de València-CSIC), Calle del Catedràtic Agustin Escardino Benlloch 9, 46980 Paterna, Spain.

Darwin Bioprospecting Excellence SL. Parc Científic Universitat de València, Calle del Catedràtic Agustin Escardino Benlloch 9, 46980 Paterna, Spain.

出版信息

Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Aug;73(8). doi: 10.1099/ijsem.0.005957.

DOI:10.1099/ijsem.0.005957
PMID:37565577
Abstract

A novel Gram-reaction-negative, facultatively anaerobic, rod-shaped, non-motile, non-spore forming, orange-pigmented bacterium identified as M10.2A, was isolated from marine residues submerged on the Malva-rosa beach (València, Spain), on the western coast of the Mediterranean Sea. This strain was catalase-positive and oxidase-negative and grew under mesophilic, neutrophilic and halophilic conditions. With respect to the 16S rRNA gene sequences, M10.2A showed similarities with DSM 19839 and IC154 (97.57 and 97.50 % gene sequence similarity, respectively). The genome of M10.2A was sequenced and has been deposited in the DDBJ/ENA/GenBank databases under the accession code JAKGTH000000000. The genomic DNA G+C content was 36.13 %. Its adscription to a novel species of the genus was confirmed by the genomic indexes average nucleotide identity by blast (ANIb) and digital DNA-DNA hybridisation (dDDH). The major fatty acids were iso-C, iso-CG, iso-C 3-OH, iso-C 3-OH and summed feature 3 (Cω7/Cω6). According to the results of this polyphasic study, strain M10.2A represents a novel species of the genus , for which name sp. nov. (type strain M10.2A = CECT 30308 = DSM 112385) is proposed.

摘要

一株新型革兰氏反应阴性、兼性厌氧、杆状、非运动、非孢子形成、橙色着色的细菌,被鉴定为 M10.2A,从马尔瓦-罗萨海滩(西班牙瓦伦西亚)的海洋沉积物中分离出来,位于地中海西部海岸。该菌株过氧化氢酶阳性,氧化酶阴性,在中温、嗜中性和嗜盐条件下生长。根据 16S rRNA 基因序列,M10.2A 与 DSM 19839 和 IC154 具有相似性(分别为 97.57%和 97.50%的基因序列相似性)。M10.2A 的基因组已测序,并已在 DDBJ/ENA/GenBank 数据库中以 JAKGTH000000000 登录号进行了存储。基因组 DNA G+C 含量为 36.13%。通过基因组索引平均核苷酸同一性比对(ANIb)和数字 DNA-DNA 杂交(dDDH),确认其属于 属的一个新种。主要脂肪酸为 iso-C、iso-CG、iso-C 3-OH、iso-C 3-OH 和总和特征 3(Cω7/Cω6)。根据多相研究的结果,菌株 M10.2A 代表了 属的一个新种,因此命名为 sp. nov.(模式菌株 M10.2A=CECT 30308=DSM 112385)。

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