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在 UCSC 基因组浏览器中对全基因组数据进行编码。

ENCODE whole-genome data in the UCSC Genome Browser.

机构信息

Center for Biomolecular Science and Engineering, School of Engineering, University of California, Santa Cruz, CA 95064, USA.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D620-5. doi: 10.1093/nar/gkp961. Epub 2009 Nov 17.

DOI:10.1093/nar/gkp961
PMID:19920125
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2808953/
Abstract

The Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) project is an international consortium of investigators funded to analyze the human genome with the goal of producing a comprehensive catalog of functional elements. The ENCODE Data Coordination Center at The University of California, Santa Cruz (UCSC) is the primary repository for experimental results generated by ENCODE investigators. These results are captured in the UCSC Genome Bioinformatics database and download server for visualization and data mining via the UCSC Genome Browser and companion tools (Rhead et al. The UCSC Genome Browser Database: update 2010, in this issue). The ENCODE web portal at UCSC (http://encodeproject.org or http://genome.ucsc.edu/ENCODE) provides information about the ENCODE data and convenient links for access.

摘要

DNA 元件百科全书 (ENCODE) 项目是一个国际研究人员联盟,由资助方提供资金,旨在分析人类基因组,目标是生成一份全面的功能元件目录。加利福尼亚大学圣克鲁兹分校(UCSC)的 ENCODE 数据协调中心是 ENCODE 研究人员生成的实验结果的主要存储库。这些结果被捕获在 UCSC 基因组生物信息学数据库中,并通过 UCSC 基因组浏览器和配套工具(Rhead 等人,《UCSC 基因组浏览器数据库:2010 年更新,本期特刊》)提供可视化和数据挖掘的下载服务器。UCSC 的 ENCODE 网络门户(http://encodeproject.org 或 http://genome.ucsc.edu/ENCODE)提供有关 ENCODE 数据的信息,并提供方便的访问链接。

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