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从海绵来源放线菌 Streptomyces sp. Sp080513GE-23 中分离得到具有独特骨架的四肽 JBIR-34 和 JBIR-35。

Tetrapeptides possessing a unique skeleton, JBIR-34 and JBIR-35, isolated from a sponge-derived actinomycete, Streptomyces sp. Sp080513GE-23.

机构信息

Biomedicinal Information Research Center, Japan Biological Informatics Consortium, 2-4-7 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan.

出版信息

J Nat Prod. 2010 Feb 26;73(2):226-8. doi: 10.1021/np900810r.

DOI:10.1021/np900810r
PMID:20146504
Abstract

Two new modified indole-containing peptides, JBIR-34 (1) and JBIR-35 (2), were isolated from the fermentation broth of a sponge-derived actinomycete identified by phylogenetic methods as a Streptomyces sp. (strain Sp080513GE-23). The planar structures of 1 and 2 were assigned on the basis of 1D and 2D NMR spectroscopy and MS analyses. Further, the absolute configurations of the amino acid residues were determined using Marfey's method.

摘要

从一种海绵来源的放线菌发酵液中分离到两种新的含吲哚修饰的肽,JBIR-34(1)和 JBIR-35(2)。该放线菌通过系统发育方法鉴定为链霉菌属(菌株 Sp080513GE-23)。根据 1D 和 2D NMR 光谱和 MS 分析确定了 1 和 2 的平面结构。此外,使用 Marfey 法确定了氨基酸残基的绝对构型。

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