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基于 16S rRNA 基因焦磷酸测序分析揭示,不同外生菌根球层具有相似的细菌群落。

Distinct ectomycorrhizospheres share similar bacterial communities as revealed by pyrosequencing-based analysis of 16S rRNA genes.

机构信息

INRA, UMR 1136 INRA-Nancy Université, Interactions Arbres Micro-organismes, Centre INRA de Nancy, Champenoux, France.

出版信息

Appl Environ Microbiol. 2012 Apr;78(8):3020-4. doi: 10.1128/AEM.06742-11. Epub 2012 Feb 3.

Abstract

Analysis of the 16S rRNA gene sequences generated from Xerocomus pruinatus and Scleroderma citrinum ectomycorrhizospheres revealed that similar bacterial communities inhabited the two ectomycorrhizospheres in terms of phyla and genera, with an enrichment of the Burkholderia genus. Compared to the bulk soil habitat, ectomycorrhizospheres hosted significantly more Alpha-, Beta-, and Gammaproteobacteria.

摘要

对皱盖牛肝菌和硫磺菌外生菌根球中 16S rRNA 基因序列的分析表明,这两种外生菌根球中的细菌群落在门和属的水平上具有相似性,其中伯克霍尔德氏菌属得到了富集。与土壤基质相比,外生菌根球中拥有更多的α-、β-和γ-变形菌纲。

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引用本文的文献

本文引用的文献

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Exploration of hitherto-uncultured bacteria from the rhizosphere.对根际中尚未培养的细菌的探索。
FEMS Microbiol Ecol. 2009 Sep;69(3):313-28. doi: 10.1111/j.1574-6941.2009.00702.x. Epub 2009 Jun 6.

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