• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

大肠杆菌核糖体RNA rrnE操纵子远端的序列表明,rrn操纵子具有共同的保守特征。

The sequence of the distal end of the E. coli ribosomal RNA rrnE operon indicates conserved features are shared by rrn operons.

作者信息

Liebke H, Hatfull G

出版信息

Nucleic Acids Res. 1985 Aug 12;13(15):5515-25. doi: 10.1093/nar/13.15.5515.

DOI:10.1093/nar/13.15.5515
PMID:2412207
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC321887/
Abstract

The 1440 nucleotides of the distal region of the E. coli ribosomal RNA operon found on the lambda aroE transducing phage has been sequenced. We show that the lambda aroE hybrid rrn operon ends after a solitary 5S RNA gene with rrnE distal sequence. A single terminator structure of dyad symmetry followed by a run of six T's have been identified and compared to other sequenced rrn terminator hairpins. Immediately adjacent to the hairpin is a region of interrupted but conserved sequence that is shared by rrnE, rrnB and rrnD. An open reading frame of 127 amino acids abuts the terminator structure. Another open reading frame of 147 amino acids is found on the opposite strand several hundred nucleotides downstream.

摘要

已对λaroE转导噬菌体上发现的大肠杆菌核糖体RNA操纵子远端区域的1440个核苷酸进行了测序。我们发现,λaroE杂交rrn操纵子在带有rrnE远端序列的单个5S RNA基因之后结束。已鉴定出一个具有二元对称性的单一终止子结构,其后跟着一串六个T,并与其他已测序的rrn终止子发夹结构进行了比较。紧邻发夹结构的是一个中断但保守的序列区域,rrnE、rrnB和rrnD共有该区域。一个127个氨基酸的开放阅读框邻接终止子结构。在下游几百个核苷酸处的相反链上发现了另一个147个氨基酸的开放阅读框。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f07c/321887/8aeb3bc92448/nar00309-0117-a.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f07c/321887/8aeb3bc92448/nar00309-0117-a.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f07c/321887/8aeb3bc92448/nar00309-0117-a.jpg

相似文献

1
The sequence of the distal end of the E. coli ribosomal RNA rrnE operon indicates conserved features are shared by rrn operons.大肠杆菌核糖体RNA rrnE操纵子远端的序列表明,rrn操纵子具有共同的保守特征。
Nucleic Acids Res. 1985 Aug 12;13(15):5515-25. doi: 10.1093/nar/13.15.5515.
2
Specificity of antitermination mechanisms. Suppression of the terminator cluster T1-T2 of Escherichia coli ribosomal RNA operon, rrnB, by phage lambda antiterminators.抗终止机制的特异性。噬菌体λ抗终止子对大肠杆菌核糖体RNA操纵子rrnB的终止子簇T1-T2的抑制作用。
J Mol Biol. 1991 Nov 5;222(1):59-66. doi: 10.1016/0022-2836(91)90737-q.
3
Nucleotide sequence of the rrnG ribosomal RNA promoter region of Escherichia coli.大肠杆菌rrnG核糖体RNA启动子区域的核苷酸序列。
Nucleic Acids Res. 1982 May 25;10(10):3303-13. doi: 10.1093/nar/10.10.3303.
4
Transcriptional termination sequence at the end of the Escherichia coli ribosomal RNA G operon: complex terminators and antitermination.大肠杆菌核糖体RNA G操纵子末端的转录终止序列:复杂终止子与抗终止作用
Nucleic Acids Res. 1991 Apr 25;19(8):1845-52. doi: 10.1093/nar/19.8.1845.
5
Comparison of the expression of the seven ribosomal RNA operons in Escherichia coli.大肠杆菌中七个核糖体RNA操纵子表达的比较。
EMBO J. 1992 Nov;11(11):4175-85. doi: 10.1002/j.1460-2075.1992.tb05511.x.
6
Tn10-mediated inversions fuse uridine phosphorylase (udp) and rRNA genes of Escherichia coli.Tn10介导的倒位融合了大肠杆菌的尿苷磷酸化酶(udp)基因和rRNA基因。
J Bacteriol. 1994 Apr;176(8):2265-71. doi: 10.1128/jb.176.8.2265-2271.1994.
7
Mapping and spacer identification of rRNA operons of Salmonella typhimurium.鼠伤寒沙门氏菌rRNA操纵子的图谱绘制与间隔区鉴定
J Bacteriol. 1984 Nov;160(2):682-6. doi: 10.1128/jb.160.2.682-686.1984.
8
Ribosomal RNA operon anti-termination. Function of leader and spacer region box B-box A sequences and their conservation in diverse micro-organisms.核糖体RNA操纵子抗终止。前导区和间隔区Box B-Box A序列的功能及其在不同微生物中的保守性。
J Mol Biol. 1989 Oct 5;209(3):345-58. doi: 10.1016/0022-2836(89)90002-8.
9
Two tRNA gene clusters associated with rRNA operons rrnD and rrnE in Bacillus subtilis.枯草芽孢杆菌中与rRNA操纵子rrnD和rrnE相关的两个tRNA基因簇。
J Bacteriol. 1993 Jan;175(2):503-9. doi: 10.1128/jb.175.2.503-509.1993.
10
Gene expression of an Escherichia coli ribosomal RNA promoter fused to structural genes of the galactose operon.与半乳糖操纵子结构基因融合的大肠杆菌核糖体RNA启动子的基因表达。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1979 Nov;76(11):5799-803. doi: 10.1073/pnas.76.11.5799.

引用本文的文献

1
Determination of oligonucleotide composition from mass spectrometrically measured molecular weight.从质谱测量的分子量确定寡核苷酸组成。
J Am Soc Mass Spectrom. 1993 Mar;4(3):204-9. doi: 10.1016/1044-0305(93)85082-9.
2
Linkage map of Escherichia coli K-12, edition 10: the traditional map.大肠杆菌K-12连锁图谱,第10版:传统图谱。
Microbiol Mol Biol Rev. 1998 Sep;62(3):814-984. doi: 10.1128/MMBR.62.3.814-984.1998.
3
Physical mapping of the scattered methionine genes on the Escherichia coli chromosome.大肠杆菌染色体上分散的甲硫氨酸基因的物理图谱

本文引用的文献

1
Automation of the computer handling of gel reading data produced by the shotgun method of DNA sequencing.DNA测序鸟枪法产生的凝胶读数数据的计算机处理自动化。
Nucleic Acids Res. 1982 Aug 11;10(15):4731-51. doi: 10.1093/nar/10.15.4731.
2
Gene organization and primary structure of a ribosomal RNA operon from Escherichia coli.大肠杆菌核糖体RNA操纵子的基因组织与一级结构
J Mol Biol. 1981 May 15;148(2):107-27. doi: 10.1016/0022-2836(81)90508-8.
3
Buffer gradient gels and 35S label as an aid to rapid DNA sequence determination.缓冲液梯度凝胶和35S标记辅助快速DNA序列测定。
J Bacteriol. 1993 Jun;175(11):3689-91. doi: 10.1128/jb.175.11.3689-3691.1993.
4
Spheroplastic phase of mycobacteria isolated from patients with Crohn's disease.从克罗恩病患者中分离出的分枝杆菌的球形体形成期。
J Clin Microbiol. 1986 Sep;24(3):357-63. doi: 10.1128/jcm.24.3.357-363.1986.
5
The 9S RNA precursor of Escherichia coli 5S RNA has three structural domains: implications for processing.大肠杆菌5S RNA的9S RNA前体有三个结构域:对加工的启示。
Nucleic Acids Res. 1988 Aug 11;16(15):7457-76. doi: 10.1093/nar/16.15.7457.
6
Structure of the DNA distal to the gene for ribosomal protein S20 in Escherichia coli K12: presence of a strong terminator and an IS1 element.大肠杆菌K12中核糖体蛋白S20基因远端的DNA结构:存在一个强终止子和一个IS1元件。
Nucleic Acids Res. 1986 Sep 11;14(17):6965-81. doi: 10.1093/nar/14.17.6965.
7
Antitermination mechanisms in rRNA operons of Escherichia coli.大肠杆菌核糖体RNA操纵子中的抗终止机制。
J Bacteriol. 1986 Oct;168(1):1-5. doi: 10.1128/jb.168.1.1-5.1986.
8
Linkage map of Escherichia coli K-12, edition 8.大肠杆菌K-12连锁图谱,第8版。
Microbiol Rev. 1990 Jun;54(2):130-97. doi: 10.1128/mr.54.2.130-197.1990.
9
Escherichia coli kgtP encodes an alpha-ketoglutarate transporter.大肠杆菌kgtP编码一种α-酮戊二酸转运蛋白。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1991 May 1;88(9):3802-6. doi: 10.1073/pnas.88.9.3802.
10
Characterization of Mycobacterium paratuberculosis and organisms of the Mycobacterium avium complex by restriction polymorphism of the rRNA gene region.通过rRNA基因区域的限制性多态性对副结核分枝杆菌和鸟分枝杆菌复合群的生物体进行鉴定。
J Clin Microbiol. 1990 Mar;28(3):489-94. doi: 10.1128/jcm.28.3.489-494.1990.
Proc Natl Acad Sci U S A. 1983 Jul;80(13):3963-5. doi: 10.1073/pnas.80.13.3963.
4
Computer methods to locate signals in nucleic acid sequences.在核酸序列中定位信号的计算机方法。
Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 2):505-19. doi: 10.1093/nar/12.1part2.505.
5
Carbon starvation and growth rate-dependent regulation of the Escherichia coli ribosomal RNA promoters: differential control of dual promoters.大肠杆菌核糖体RNA启动子的碳饥饿和生长速率依赖性调控:双启动子的差异控制
Proc Natl Acad Sci U S A. 1983 Nov;80(22):7010-3. doi: 10.1073/pnas.80.22.7010.
6
Studying promoters and terminators by gene fusion.通过基因融合研究启动子和终止子。
Science. 1983 Nov 18;222(4625):734-9. doi: 10.1126/science.6356355.
7
Evidence for antitermination in Escherichia coli RRNA transcription.大肠杆菌核糖体RNA转录中抗终止作用的证据。
J Bacteriol. 1984 Jul;159(1):260-4. doi: 10.1128/jb.159.1.260-264.1984.
8
Plasmid vectors for the selection of promoters.用于启动子选择的质粒载体。
Gene. 1984 Feb;27(2):151-60. doi: 10.1016/0378-1119(84)90136-7.
9
Fusion of the tandem Escherichia coli rrnA promoters to a transcription termination signal from the end of rrnD.串联的大肠杆菌rrnA启动子与来自rrnD末端的转录终止信号的融合。
J Mol Biol. 1983 Aug 15;168(3):557-61. doi: 10.1016/s0022-2836(83)80301-5.
10
Random subcloning of sonicated DNA: application to shotgun DNA sequence analysis.经超声处理的DNA的随机亚克隆:在鸟枪法DNA序列分析中的应用
Anal Biochem. 1983 Feb 15;129(1):216-23. doi: 10.1016/0003-2697(83)90072-6.