G4HunterApps。
G4HunterApps.
机构信息
IBENS, ENS-CNRS UMR8197, Inserm U1024, Ecole Normale Supérieure, Paris Cedex 05, France.
出版信息
Bioinformatics. 2019 Jul 1;35(13):2311-2312. doi: 10.1093/bioinformatics/bty951.
Abstract
MOTIVATION
In order to help G4Hunter users and make it more accessible, I have developed a set of small applications within the Shiny/R framework.
RESULTS
Each application fulfils simple tasks ranging from computing the G4Hunter score for a sequence or a list of sequence to extracting sequences with a G4Hunter score above a threshold for a sequence up to 5 Mb or a list of short sequences. The application can be installed either on the user computer within Rstudio or on a Rstudio server.
AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION
The source code for the ShinyApps is available on GitHub (https://github.com/LacroixLaurent).
摘要
动机
为了帮助 G4Hunter 用户并使其更易于访问，我在 Shiny/R 框架内开发了一组小型应用程序。
结果
每个应用程序都执行简单的任务，从计算序列或序列列表的 G4Hunter 得分，到提取 G4Hunter 得分超过阈值的序列（长达 5 Mb 或短序列列表）。该应用程序可以在用户计算机上的 Rstudio 中安装，也可以在 Rstudio 服务器上安装。
可用性和实现
ShinyApps 的源代码可在 GitHub 上获得（https://github.com/LacroixLaurent）。
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