• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

酰基载体蛋白与酮合成酶相互作用的分子基础。

Molecular basis for interactions between an acyl carrier protein and a ketosynthase.

机构信息

Department of Molecular Biology and Biochemistry, University of California, Irvine, Irvine, CA, USA.

Department of Chemistry and Biochemistry, University of California, San Diego, La Jolla, CA, USA.

出版信息

Nat Chem Biol. 2019 Jul;15(7):669-671. doi: 10.1038/s41589-019-0301-y. Epub 2019 Jun 17.

DOI:10.1038/s41589-019-0301-y
PMID:31209348
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7323458/
Abstract

Fatty acid synthases are dynamic ensembles of enzymes that can biosynthesize long hydrocarbon chains efficiently. Here we visualize the interaction between the Escherichia coli acyl carrier protein (AcpP) and β-ketoacyl-ACP-synthase I (FabB) using X-ray crystallography, NMR, and molecular dynamics simulations. We leveraged this structural information to alter lipid profiles in vivo and provide a molecular basis for how protein-protein interactions can regulate the fatty acid profile in E. coli.

摘要

脂肪酸合酶是一种动态的酶复合物,能够有效地生物合成长链烃。在这里,我们使用 X 射线晶体学、NMR 和分子动力学模拟技术可视化了大肠杆菌酰基辅酶 A 载体蛋白(AcpP)和β-酮酰-ACP 合酶 I(FabB)之间的相互作用。我们利用这些结构信息在体内改变脂质谱,并为蛋白质-蛋白质相互作用如何调节大肠杆菌中的脂肪酸谱提供了分子基础。

相似文献

1
Molecular basis for interactions between an acyl carrier protein and a ketosynthase.酰基载体蛋白与酮合成酶相互作用的分子基础。
Nat Chem Biol. 2019 Jul;15(7):669-671. doi: 10.1038/s41589-019-0301-y. Epub 2019 Jun 17.
2
Structure, High Affinity, and Negative Cooperativity of the Escherichia coli Holo-(Acyl Carrier Protein):Holo-(Acyl Carrier Protein) Synthase Complex.大肠杆菌全(酰基载体蛋白):全(酰基载体蛋白)合酶复合物的结构、高亲和力和负协同性。
J Mol Biol. 2017 Nov 24;429(23):3763-3775. doi: 10.1016/j.jmb.2017.10.015. Epub 2017 Oct 18.
3
Gating mechanism of elongating β-ketoacyl-ACP synthases.延伸β-酮酰基-ACP 合酶的门控机制。
Nat Commun. 2020 Apr 7;11(1):1727. doi: 10.1038/s41467-020-15455-x.
4
Crystal structures of acyl carrier protein in complex with two catalytic partners show a dynamic role in cellular metabolism.与两种催化伙伴结合的酰基载体蛋白的晶体结构在细胞代谢中显示出动态作用。
Chembiochem. 2014 May 26;15(8):1079-81. doi: 10.1002/cbic.201402095. Epub 2014 Apr 25.
5
Trapping the dynamic acyl carrier protein in fatty acid biosynthesis.捕获脂肪酸生物合成中的动态酰基载体蛋白。
Nature. 2014 Jan 16;505(7483):427-31. doi: 10.1038/nature12810. Epub 2013 Dec 22.
6
Mapping a ketosynthase:acyl carrier protein binding interface via unnatural amino acid-mediated photo-cross-linking.通过非天然氨基酸介导的光交联映射酮合成酶:酰基载体蛋白结合界面
Biochemistry. 2014 Dec 9;53(48):7494-502. doi: 10.1021/bi500936u. Epub 2014 Nov 26.
7
Fatty acid synthesis. Role of active site histidines and lysine in Cys-His-His-type beta-ketoacyl-acyl carrier protein synthases.脂肪酸合成。活性位点组氨酸和赖氨酸在半胱氨酸-组氨酸-组氨酸型β-酮脂酰-酰基载体蛋白合酶中的作用。
FEBS J. 2006 Feb;273(4):695-710. doi: 10.1111/j.1742-4658.2005.05101.x.
8
The Mycobacterium tuberculosis beta-ketoacyl-acyl carrier protein synthase III activity is inhibited by phosphorylation on a single threonine residue.结核分枝杆菌β-酮酰基-酰基载体蛋白合酶III的活性通过单个苏氨酸残基的磷酸化作用而受到抑制。
J Biol Chem. 2009 Mar 6;284(10):6414-24. doi: 10.1074/jbc.M806537200. Epub 2008 Dec 11.
9
Suppression of fabB Mutation by fabF1 Is Mediated by Transcription Read-through in Shewanella oneidensis.在嗜冷栖热袍菌中,fabF1对fabB突变的抑制作用是通过转录通读介导的。
J Bacteriol. 2016 Oct 21;198(22):3060-3069. doi: 10.1128/JB.00463-16. Print 2016 Nov 15.
10
Substrate recognition by β-ketoacyl-ACP synthases.β-酮酰基-ACP 合酶对底物的识别。
Biochemistry. 2011 Dec 13;50(49):10678-86. doi: 10.1021/bi201199x. Epub 2011 Nov 17.

引用本文的文献

1
The enzyme kinetics of branched-chain fatty acid synthesis of metazoan fatty acid synthase.后生动物脂肪酸合酶的支链脂肪酸合成的酶动力学
Protein Sci. 2025 Aug;34(8):e70229. doi: 10.1002/pro.70229.
2
Elucidating the Iterative Elongation Mechanism in a Type III Polyketide Synthase.阐明III型聚酮合酶中的迭代延伸机制。
J Am Chem Soc. 2025 May 14;147(19):16705-16714. doi: 10.1021/jacs.5c05635. Epub 2025 May 1.
3
Strategic Acyl Carrier Protein Engineering Enables Functional Type II Polyketide Synthase Reconstitution In Vitro.

本文引用的文献

1
Analysis and engineering of substrate shuttling by the acyl carrier protein (ACP) in fatty acid synthases (FASs).酰基载体蛋白(ACP)在脂肪酸合酶(FASs)中底物穿梭的分析与工程改造。
Chem Commun (Camb). 2018 Oct 11;54(82):11606-11609. doi: 10.1039/c8cc06838k.
2
Acyl Carrier Protein Cyanylation Delivers a Ketoacyl Synthase-Carrier Protein Cross-Link.酰基载体蛋白氰化作用形成酮酰基合酶-载体蛋白交联。
Biochemistry. 2017 May 23;56(20):2533-2536. doi: 10.1021/acs.biochem.7b00219. Epub 2017 May 8.
3
Engineering fatty acid synthases for directed polyketide production.
战略性酰基载体蛋白工程实现功能性II型聚酮合酶的体外重构。
ACS Chem Biol. 2025 Jan 17;20(1):197-207. doi: 10.1021/acschembio.4c00678. Epub 2025 Jan 2.
4
Module-Based Polyketide Synthase Engineering for Polyketide Biosynthesis.基于模块的聚酮合酶工程在聚酮生物合成中的应用。
ACS Synth Biol. 2023 Nov 17;12(11):3148-3155. doi: 10.1021/acssynbio.3c00282. Epub 2023 Oct 23.
5
Interface Engineering of Carrier-Protein-Dependent Metabolic Pathways.载体蛋白依赖性代谢途径的界面工程。
ACS Chem Biol. 2023 Sep 15;18(9):2014-2022. doi: 10.1021/acschembio.3c00238. Epub 2023 Sep 6.
6
Using NMR Titration Experiments to Study E. coli FAS-II- and AcpP-Mediated Protein-Protein Interactions.利用核磁共振滴定实验研究大肠杆菌Ⅱ型脂肪酸合成酶和酰基载体蛋白介导的蛋白质-蛋白质相互作用。
Methods Mol Biol. 2023;2670:49-68. doi: 10.1007/978-1-0716-3214-7_3.
7
A Review of Fatty Acid Biosynthesis Enzyme Inhibitors as Promising Antimicrobial Drugs.脂肪酸生物合成酶抑制剂作为有前景的抗菌药物的综述
Pharmaceuticals (Basel). 2023 Mar 10;16(3):425. doi: 10.3390/ph16030425.
8
Enzymology of assembly line synthesis by modular polyketide synthases.模块化聚酮合酶进行流水线式合成的酶学
Nat Chem Biol. 2023 Apr;19(4):401-415. doi: 10.1038/s41589-023-01277-7. Epub 2023 Mar 13.
9
Anammox Bacterial -Adenosyl-l-Methionine Dependent Methyltransferase Crystal Structure and Its Interaction with Acyl Carrier Proteins.厌氧氨氧化菌(Anammox bacteria)-腺苷甲硫氨酸依赖型甲基转移酶的晶体结构及其与酰基辅酶 A 载体蛋白的相互作用。
Int J Mol Sci. 2023 Jan 1;24(1):744. doi: 10.3390/ijms24010744.
10
Structure and mechanistic analyses of the gating mechanism of elongating ketosynthases.延伸酮合成酶门控机制的结构与机理分析
ACS Catal. 2021 Jun 18;11(12):6787-6799. doi: 10.1021/acscatal.1c00745. Epub 2021 May 26.
工程化脂肪酸合酶以定向聚酮化合物的生产。
Nat Chem Biol. 2017 Apr;13(4):363-365. doi: 10.1038/nchembio.2314. Epub 2017 Feb 20.
4
Crystal structure of FabZ-ACP complex reveals a dynamic seesaw-like catalytic mechanism of dehydratase in fatty acid biosynthesis.FabZ-ACP复合物的晶体结构揭示了脂肪酸生物合成中脱水酶类似跷跷板的动态催化机制。
Cell Res. 2016 Dec;26(12):1330-1344. doi: 10.1038/cr.2016.136. Epub 2016 Nov 22.
5
Using modern tools to probe the structure-function relationship of fatty acid synthases.利用现代工具探究脂肪酸合酶的结构-功能关系。
Chembiochem. 2015 Mar 2;16(4):528-547. doi: 10.1002/cbic.201402578. Epub 2015 Feb 10.
6
NMRFAM-SPARKY: enhanced software for biomolecular NMR spectroscopy.NMRFAM-SPARKY:用于生物分子核磁共振光谱学的增强软件。
Bioinformatics. 2015 Apr 15;31(8):1325-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btu830. Epub 2014 Dec 12.
7
Visualizing the chain-flipping mechanism in fatty-acid biosynthesis.可视化脂肪酸生物合成中的链翻转机制。
Angew Chem Int Ed Engl. 2014 Dec 22;53(52):14456-61. doi: 10.1002/anie.201408576. Epub 2014 Oct 29.
8
The chain-flipping mechanism of ACP (acyl carrier protein)-dependent enzymes appears universal.ACP(酰基载体蛋白)依赖性酶的翻转机制似乎具有普遍性。
Biochem J. 2014 Jun 1;460(2):157-63. doi: 10.1042/BJ20140239.
9
Trapping the dynamic acyl carrier protein in fatty acid biosynthesis.捕获脂肪酸生物合成中的动态酰基载体蛋白。
Nature. 2014 Jan 16;505(7483):427-31. doi: 10.1038/nature12810. Epub 2013 Dec 22.
10
Using chemical shift perturbation to characterise ligand binding.利用化学位移扰动来表征配体结合。
Prog Nucl Magn Reson Spectrosc. 2013 Aug;73:1-16. doi: 10.1016/j.pnmrs.2013.02.001. Epub 2013 Mar 21.