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NFAT-133/TM-123 生物合成途径的功能研究与修正。

Functional Studies and Revision of the NFAT-133/TM-123 Biosynthetic Pathway in .

机构信息

Department of Pharmaceutical Sciences, Oregon State University, Corvallis, Oregon 97331-3507, United States.

Department of Molecular Biosciences, The University of Texas at Austin, Austin, Texas 78712, United States.

出版信息

ACS Chem Biol. 2022 Aug 19;17(8):2039-2045. doi: 10.1021/acschembio.2c00454. Epub 2022 Jul 29.

Abstract

The biosynthetic gene cluster of NFAT-133, an inhibitor of the nuclear factor of activated T cells, was recently identified in ATCC 27456. This cluster is conspicuous by its highly disordered noncollinear type I modular polyketide synthase (PKS) genes that encode PKSs with one module more than those expected for the heptaketide NFAT-133 biosynthesis. Thus, the major metabolite NFAT-133 was proposed to derive from an octaketide analogue, TM-123. Here, we report that further bioinformatic analysis and gene inactivation studies suggest that NFAT-133 is not derived from TM-123 but rather a product of programmed KS extension skipping of a nascent heptaketide from the PKS assembly line that produces TM-123. Furthermore, identification of NFAT-133/TM-123 analogues from mutants of the ATCC 27456 strain suggests that NftN (a putative dehydrogenase), NftE (a cytochrome P450), and NftG (a putative hydrolase/decarboxylase) function "" during the polyketide chain assembly processes.

摘要

最近在 ATCC 27456 中鉴定出了 NFAT-133 的生物合成基因簇,NFAT-133 是一种核因子活化 T 细胞的抑制剂。该基因簇的特点是高度无序的非共线性 I 型多功能聚酮合酶(PKS)基因,这些基因编码的 PKS 比预期的七酮 NFAT-133 生物合成多一个模块。因此,推测主要代谢产物 NFAT-133 来源于八酮类似物 TM-123。在这里,我们报告说,进一步的生物信息学分析和基因失活研究表明,NFAT-133 不是来源于 TM-123,而是 TM-123 产生的 PKS 装配线上新生七酮的 KS 延伸跳过的产物。此外,从 ATCC 27456 菌株的突变体中鉴定出 NFAT-133/TM-123 类似物表明,NftN(一种假定的脱氢酶)、NftE(一种细胞色素 P450)和 NftG(一种假定的水解酶/脱羧酶)在聚酮链组装过程中发挥作用。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/23d7/9391300/54aca9912d68/nihms-1826602-f0002.jpg

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