• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

对来自加利福尼亚湾的三种海洋菌株的基因组洞察

Genomic Insight into Three Marine sp. Strains from the Gulf of California.

作者信息

Contreras-Castro Luis, Maldonado Luis A, Quintana Erika T, Carro Lorena, Klenk Hans-Peter

机构信息

Laboratorio de Bioprospección en Actinobacterias, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas (ENCB), Instituto Politécnico Nacional (IPN), Mexico City, Mexico

Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2019 Jul 11;8(28):e01673-18. doi: 10.1128/MRA.01673-18.

DOI:10.1128/MRA.01673-18
PMID:31296693
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6624776/
Abstract

Three actinomycete strains, designated BL1, BL4, and CV4, were isolated from sediment samples from the Gulf of California in 2009 together with nearly 300 other actinobacteria. Genome mining and analysis of their ∼6.4-Mb sequences confirmed the bioprospecting potential of these three bacteria belonging to the genus .

摘要

2009年,从加利福尼亚湾的沉积物样本中分离出三株放线菌菌株,分别命名为BL1、BL4和CV4,同时还分离出了近300株其他放线菌。对它们约640kb序列的基因组挖掘和分析证实了这三株属于该属的细菌具有生物勘探潜力。

相似文献

1
Genomic Insight into Three Marine sp. Strains from the Gulf of California.对来自加利福尼亚湾的三种海洋菌株的基因组洞察
Microbiol Resour Announc. 2019 Jul 11;8(28):e01673-18. doi: 10.1128/MRA.01673-18.
2
Draft Genome Sequence of Two Marine Plantactinospora spp. from the Gulf of California.来自加利福尼亚湾的两种海洋嗜皮菌属物种的基因组序列草图
Genome Announc. 2018 May 24;6(21):e00436-18. doi: 10.1128/genomeA.00436-18.
3
A study of three bacteria isolated from marine sediment and description of Micromonospora globispora sp. nov.从海洋沉积物中分离出的三种细菌的研究及新种 Globispora minutispora 的描述。
Syst Appl Microbiol. 2019 Mar;42(2):190-197. doi: 10.1016/j.syapm.2018.11.003. Epub 2018 Nov 16.
4
sp. nov., a new species of the genus isolated from deep-sea sediment in Japan.sp. nov.,一种新的属种,从日本深海沉积物中分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2020 May;70(5):3069-3075. doi: 10.1099/ijsem.0.004136.
5
Micromonospora spongicola sp. nov., an actinomycete isolated from a marine sponge in the Gulf of Thailand.微单孢菌属海绵亚种,一种从泰国湾海洋海绵中分离得到的放线菌。
J Antibiot (Tokyo). 2013 Sep;66(9):505-9. doi: 10.1038/ja.2013.35. Epub 2013 May 15.
6
Micromonospora craniellae sp. nov., isolated from a marine sponge, and reclassification of Jishengella endophytica as Micromonospora endophytica comb. nov.新枝霉素属 craniellae 种,海洋海绵中分离得到的一株新的放线菌,内生棘孢小单孢菌(Jishengella endophytica)归入新枝霉素属(Micromonospora)内作为 Micromonospora endophytica comb. nov.
Int J Syst Evol Microbiol. 2019 Mar;69(3):715-720. doi: 10.1099/ijsem.0.003209. Epub 2019 Jan 3.
7
Micromonospora profundi sp. nov., isolated from deep marine sediment.从深海沉积物中分离出的新种深栖小单孢菌。
Int J Syst Evol Microbiol. 2016 Nov;66(11):4735-4743. doi: 10.1099/ijsem.0.001419. Epub 2016 Aug 11.
8
Micromonospora orduensis sp. nov., isolated from deep marine sediment.Orduensis 微单胞菌属,分离自深海沉积物。
Antonie Van Leeuwenhoek. 2020 Mar;113(3):397-405. doi: 10.1007/s10482-019-01349-6. Epub 2019 Oct 19.
9
Two new species of the genus Micromonospora: Micromonospora chokoriensis sp. nov. and Micromonospora coxensis sp. nov., isolated from sandy soil.小单孢菌属的两个新物种:乔科里小单孢菌新种和考克斯小单孢菌新种,从沙质土壤中分离得到。
J Gen Appl Microbiol. 2007 Feb;53(1):29-37. doi: 10.2323/jgam.53.29.
10
Structure elucidation and antitumour activity of a new macrolactam produced by marine-derived actinomycete Micromonospora sp. FIM05328.海洋来源放线菌小单孢菌属Micromonospora sp. FIM05328产生的一种新型大环内酰胺的结构解析及抗肿瘤活性
Nat Prod Res. 2018 Sep;32(18):2133-2138. doi: 10.1080/14786419.2017.1366479. Epub 2017 Aug 20.

引用本文的文献

1
Exploring omics strategies for drug discovery from isolated from the marine ecosystem.探索从海洋生态系统中分离出来用于药物发现的组学策略。
Front Pharmacol. 2025 Aug 15;16:1634207. doi: 10.3389/fphar.2025.1634207. eCollection 2025.
2
Genome and Compound Analysis of Sioxanthin-Producing Marine Actinobacterium Micromonospora sp. nov. Strain SH-82 Isolated from Sponge Scopalina hapalia.海绵斯卡伯勒娜属中一株产虾青素海洋放线菌 Micromonospora sp. 新种 SH-82 的基因组和化合物分析
Curr Microbiol. 2024 Aug 6;81(9):298. doi: 10.1007/s00284-024-03812-8.
3
Biotechnological and Ecological Potential of sp. nov., a Gifted Strain Isolated from the Challenger Deep of the Mariana Trench.nov. sp.,一种从马里亚纳海沟挑战者深渊中分离出的优秀菌株的生物技术和生态学潜力。
Mar Drugs. 2021 Apr 25;19(5):243. doi: 10.3390/md19050243.

本文引用的文献

1
Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum .基于基因组的门的分类学分类 。
Front Microbiol. 2018 Aug 22;9:2007. doi: 10.3389/fmicb.2018.02007. eCollection 2018.
2
Micromonospora azadirachtae sp. nov., isolated from roots of Azadirachta indica A. Juss. var. siamensis Valeton.印楝小单孢菌新种,从印楝(Azadirachta indica A. Juss.)暹罗变种(Azadirachta indica A. Juss. var. siamensis Valeton.)的根部分离得到。
Antonie Van Leeuwenhoek. 2019 Feb;112(2):253-262. doi: 10.1007/s10482-018-1152-3. Epub 2018 Aug 30.
3
Genome-based classification of micromonosporae with a focus on their biotechnological and ecological potential.基于基因组的微单孢子菌分类及其生物技术和生态潜力的重点。
Sci Rep. 2018 Jan 11;8(1):525. doi: 10.1038/s41598-017-17392-0.
4
Proposed minimal standards for the use of genome data for the taxonomy of prokaryotes.关于将基因组数据用于原核生物分类学的拟议最低标准。
Int J Syst Evol Microbiol. 2018 Jan;68(1):461-466. doi: 10.1099/ijsem.0.002516.
5
Introducing EzBioCloud: a taxonomically united database of 16S rRNA gene sequences and whole-genome assemblies.推出 EzBioCloud:一个统一分类学的 16S rRNA 基因序列和全基因组组装数据库。
Int J Syst Evol Microbiol. 2017 May;67(5):1613-1617. doi: 10.1099/ijsem.0.001755. Epub 2017 May 30.
6
Micromonospora fluostatini sp. nov., isolated from marine sediment.新种氟司他汀小单孢菌,从海洋沉积物中分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2015 Dec;65(12):4417-4423. doi: 10.1099/ijsem.0.000589. Epub 2015 Sep 9.
7
antiSMASH 3.0-a comprehensive resource for the genome mining of biosynthetic gene clusters.antiSMASH 3.0——用于生物合成基因簇基因组挖掘的综合资源。
Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(W1):W237-43. doi: 10.1093/nar/gkv437. Epub 2015 May 6.
8
Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data.Trimmomatic:一款适用于 Illumina 测序数据的灵活修剪工具。
Bioinformatics. 2014 Aug 1;30(15):2114-20. doi: 10.1093/bioinformatics/btu170. Epub 2014 Apr 1.
9
Micromonospora spongicola sp. nov., an actinomycete isolated from a marine sponge in the Gulf of Thailand.微单孢菌属海绵亚种,一种从泰国湾海洋海绵中分离得到的放线菌。
J Antibiot (Tokyo). 2013 Sep;66(9):505-9. doi: 10.1038/ja.2013.35. Epub 2013 May 15.
10
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing.SPAdes:一种新的基因组组装算法及其在单细胞测序中的应用
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77. doi: 10.1089/cmb.2012.0021. Epub 2012 Apr 16.