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一个用于实现和搜索序列数据库的通用理念及 FORTRAN 77 软件包。

A common philosophy and FORTRAN 77 software package for implementing and searching sequence databases.

作者信息

Claverie J M

出版信息

Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 1):397-407. doi: 10.1093/nar/12.1part1.397.

DOI:10.1093/nar/12.1part1.397
PMID:6546424
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC321013/
Abstract

I present a common philosophy for implementing the EMBL and GENBANK (BBN-Los Alamos) nucleic acid sequence databases, as well as the National Biological Foundation (Dayhoff) protein sequence database. The associated FORTRAN 77 fully transportable software package includes: 1) modules for implementing each of these databases from the initial magnetic tape file, 2) modules performing a fast mnemonic access, 3) modules performing key-string access and allowing the definition of user-specific database subsets, 4) a common probe searching module allowing the stacking of multiple combined search requests over the databases. This software is particularly suitable for 32-bit mini/microcomputers but would eventually run on 16-bit computers.

摘要

我介绍一种用于实现欧洲分子生物学实验室（EMBL）和基因银行（BBN - 洛斯阿拉莫斯）核酸序列数据库以及国家生物基金会（戴霍夫）蛋白质序列数据库的通用理念。相关的FORTRAN 77完全可移植软件包包括：1）用于从初始磁带文件实现这些数据库中每个数据库的模块；2）执行快速助记符访问的模块；3）执行键串访问并允许定义用户特定数据库子集的模块；4）一个通用探针搜索模块，允许在数据库上堆叠多个组合搜索请求。该软件特别适用于32位小型/微型计算机，但最终也可在16位计算机上运行。

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The F-actin capping proteins of Physarum polycephalum: cap42(a) is very similar, if not identical, to fragmin and is structurally and functionally very homologous to gelsolin; cap42(b) is Physarum actin.多头绒泡菌的F-肌动蛋白封端蛋白：帽蛋白42(a)即便不完全相同，也与凝溶蛋白非常相似，并且在结构和功能上与凝溶胶蛋白高度同源；帽蛋白42(b)是绒泡菌肌动蛋白。
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