克隆于酵母人工染色体中的枯草芽孢杆菌DNA片段的有序集合。
An ordered collection of Bacillus subtilis DNA segments cloned in yeast artificial chromosomes.
作者信息
Azevedo V, Alvarez E, Zumstein E, Damiani G, Sgaramella V, Ehrlich S D, Serror P
机构信息
Laboratoire de Génétique Microbienne, Institut National de la Recherche Agronomique, Jouy en Josas, France.
出版信息
Proc Natl Acad Sci U S A. 1993 Jul 1;90(13):6047-51. doi: 10.1073/pnas.90.13.6047.
Abstract
A collection of 772 Bacillus subtilis DNA segments was obtained by cloning in yeast artificial chromosomes. The B. subtilis inserts of 288 clones were mapped by hybridization using as probes 65 cloned genes and 188 isolated insert ends. In this way, 59 inserts were ordered in four contigs that cover > 98% of the B. subtilis chromosome. This ordered collection is now available for further genetic and physical analysis of the B. subtilis genome.
摘要
通过酵母人工染色体克隆获得了772个枯草芽孢杆菌DNA片段的集合。使用65个克隆基因和188个分离的插入末端作为探针，通过杂交对288个克隆的枯草芽孢杆菌插入片段进行了定位。通过这种方式，59个插入片段被排列在四个重叠群中，覆盖了> 98%的枯草芽孢杆菌染色体。这个有序的集合现在可用于枯草芽孢杆菌基因组的进一步遗传和物理分析。
相似文献
1
克隆于酵母人工染色体中的枯草芽孢杆菌DNA片段的有序集合。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1993 Jul 1;90(13):6047-51. doi: 10.1073/pnas.90.13.6047.
2
对克隆于酵母人工染色体中的枯草芽孢杆菌染色体上serA和kdg基因座之间区域的序列分析。
Microbiology (Reading). 1996 Aug;142 ( Pt 8):2005-16. doi: 10.1099/13500872-142-8-2005.
3
通过在酵母人工染色体中随机克隆对黄色粘球菌基因组进行物理图谱绘制。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1989 Nov;86(22):8917-21. doi: 10.1073/pnas.86.22.8917.
4
Complete physical map of the Bacillus subtilis 168 chromosome constructed by a gene-directed mutagenesis method.
J Mol Biol. 1991 Aug 5;220(3):631-48. doi: 10.1016/0022-2836(91)90106-g.
5
枯草芽孢杆菌168染色体在kdg与SPβ原噬菌体附着位点之间的组织：利用长片段精确PCR和酵母人工染色体进行测序
Microbiology (Reading). 1996 Nov;142 ( Pt 11):3005-15. doi: 10.1099/13500872-142-11-3005.
6
Mapping of the 150 kb spoIIIC-pheA region of the Bacillus subtilis chromosome using Long Accurate PCR and three yeast artificial chromosomes.
Microbiology (Reading). 1996 Nov;142 ( Pt 11):3017-20. doi: 10.1099/13500872-142-11-3017.
7
[枯草芽孢杆菌质粒克隆的lysA基因整合到该微生物的染色体中]
Genetika. 1992 Jun;28(6):29-34.
8
枯草芽孢杆菌168染色体的ampS - nprE（124度 - 127度）区域：一段27 kb片段的测序及该区域几个基因的鉴定
Microbiology (Reading). 1996 Nov;142 ( Pt 11):3033-7. doi: 10.1099/13500872-142-11-3033.
9
[利用重组质粒对枯草芽孢杆菌染色体210度区域的研究]
Mol Gen Mikrobiol Virusol. 1987 Feb(2):20-4.
10
黄色粘球菌染色体的物理图谱。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1994 Sep 27;91(20):9584-7. doi: 10.1073/pnas.91.20.9584.
引用本文的文献
1
将细胞融合与 CRISPR-Cas9 编辑相结合，用于在酵母中克隆大片段 DNA 或完整的细菌基因组。
ACS Synth Biol. 2023 Nov 17;12(11):3252-3266. doi: 10.1021/acssynbio.3c00248. Epub 2023 Oct 16.
2
在酵母中克隆全细菌基因组。
Nucleic Acids Res. 2010 May;38(8):2558-69. doi: 10.1093/nar/gkq119. Epub 2010 Mar 7.
3
生物技术的搜索与发现策略：范式转变
Microbiol Mol Biol Rev. 2000 Sep;64(3):573-606. doi: 10.1128/MMBR.64.3.573-606.2000.
4
枯草芽孢杆菌spoIIR基因中TGA突变被prfB突变抑制。
J Bacteriol. 1998 Aug;180(16):4166-70. doi: 10.1128/JB.180.16.4166-4170.1998.
5
霍乱弧菌569B基因组的有序克隆DNA图谱及遗传标记的定位
J Bacteriol. 1998 Feb;180(4):901-8. doi: 10.1128/JB.180.4.901-908.1998.
6
在枯草芽孢杆菌168染色体中寻找额外的复制终止子。
J Bacteriol. 1997 May;179(10):3358-61. doi: 10.1128/jb.179.10.3358-3361.1997.
7
枯草芽孢杆菌中细胞色素c合成所需的ccdA基因的鉴定与表征。
J Bacteriol. 1997 Mar;179(6):1962-73. doi: 10.1128/jb.179.6.1962-1973.1997.
8
枯草芽孢杆菌的CotM是应激蛋白α-晶状体蛋白家族的成员，在发育过程中被诱导，并参与孢子外被的形成。
J Bacteriol. 1997 Mar;179(6):1887-97. doi: 10.1128/jb.179.6.1887-1897.1997.
9
枯草芽孢杆菌GltR（一种LysR家族成员）突变形式的转录激活特异性改变。
J Bacteriol. 1997 Feb;179(4):1035-43. doi: 10.1128/jb.179.4.1035-1043.1997.
10
cse15、cse60和csk22是枯草芽孢杆菌中母细胞特异性孢子形成调节子的新成员。
J Bacteriol. 1997 Jan;179(2):389-98. doi: 10.1128/jb.179.2.389-398.1997.
本文引用的文献
1
构建秀丽隐杆线虫基因组物理图谱。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1986 Oct;83(20):7821-5. doi: 10.1073/pnas.83.20.7821.
2
控制枯草芽孢杆菌利用木聚糖的基因。
J Bacteriol. 1983 Oct;156(1):257-63. doi: 10.1128/jb.156.1.257-263.1983.
3
酵母基因组限制性图谱绘制的随机克隆策略。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1986 Oct;83(20):7826-30. doi: 10.1073/pnas.83.20.7826.
4
无细胞融合的酵母原生质体转化
Anal Biochem. 1987 Jun;163(2):391-7. doi: 10.1016/0003-2697(87)90240-5.
5
利用酵母人工染色体进行基因组连接。
Nature. 1988 Sep 8;335(6186):184-6. doi: 10.1038/335184a0.
6
通过高压电穿孔实现大肠杆菌的高效转化。
Nucleic Acids Res. 1988 Jul 11;16(13):6127-45. doi: 10.1093/nar/16.13.6127.
7
完整大肠杆菌染色体的物理图谱：一种用于大型基因组文库快速分析和分类的新策略的应用
Cell. 1987 Jul 31;50(3):495-508. doi: 10.1016/0092-8674(87)90503-4.
8
通过人工染色体载体将大片段外源DNA克隆到酵母中。
Science. 1987 May 15;236(4803):806-12. doi: 10.1126/science.3033825.
9
反向聚合酶链反应的遗传学应用
Genetics. 1988 Nov;120(3):621-3. doi: 10.1093/genetics/120.3.621.
10
大肠杆菌K-12 W3110染色体有序黏粒文库的构建。
J Bacteriol. 1989 Feb;171(2):1214-8. doi: 10.1128/jb.171.2.1214-1218.1989.
Zotero 插件